Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A3Q8WWT9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms