Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC11Q7Z392 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC11Q7Z392 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms