Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF4Q2M2E3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF4Q2M2E3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF4Q2M2E3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ODF4Q2M2E3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF4Q2M2E3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms