Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR1D2Q14995 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR1D2Q14995 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR1D2Q14995 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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