Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCNA1Q09470 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNA1Q09470 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA1Q09470 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms