Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KPNA2P52292 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms