Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VEGFCP49767 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VEGFCP49767 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms