Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCP4P48539 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCP4P48539 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCP4P48539 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCP4P48539 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCP4P48539 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCP4P48539 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCP4P48539 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCP4P48539 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCP4P48539 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCP4P48539 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms