Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A2P43004 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms