Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00271P0C7V0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00271P0C7V0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms