Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRIQ3A6PVS8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRIQ3A6PVS8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms