Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM3Q9BZL3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM3Q9BZL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms