Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNHG12Q9BXW3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms