Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SMIM12Q96EX1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms