Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2CD4AQ8NCU7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms