Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 YER165C-AYER165C-A 357 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YGR219WYGR219W 342 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YJL147CYJL147C 1149 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YKR073CYKR073C 321 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SPC3YLR066W 555 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 EMG1YLR186W 759 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 COS3YML132W 1140 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YMR082CYMR082C 357 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 snR11snR11 258 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MCA1YOR197W 1299 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 RDL2YOR286W 450 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MRPS16YPL013C 366 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 snR44snR44 211 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 COS2YBR302C 1140 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 EMW1YNL313C 2715 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PRB1YEL060C 1908 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MSB3YNL293W 1902 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PCL8YPL219W 1479 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 FUM1YPL262W 1467 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PRC1YMR297W 1599 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SRV2YNL138W 1581 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 HSP42YDR171W 1128 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 HNT2YDR305C 654 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SEH1YGL100W 1050 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YGR122WYGR122W 1209 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PAN6YIL145C 930 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 NNT1YLR285W 786 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 ARR3YPR201W 1215 nt6.67□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 ERS1YCR075C 783 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PGU1YJR153W 1086 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YNL143CYNL143C 393 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YPL062WYPL062W 405 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MKC7YDR144C 1791 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SLT2YHR030C 1455 nt6.66□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PAC2YER007W 1557 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 GIP2YER054C 1647 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 DDC1YPL194W 1839 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YDR056CYDR056C 618 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 CWC21YDR482C 408 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SPG3YDR504C 384 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YER134CYER134C 537 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MMF1YIL051C 438 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YKL151CYKL151C 1014 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YBL077WYBL077W 432 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SPS18YNL204C 903 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 ATO2YNR002C 849 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 TOA1YOR194C 861 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MRP51YPL118W 1035 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SAM4YPL273W 978 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SHE3YBR130C 1278 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt6.65□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 RPN6YDL097C 1305 nt6.65□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 CDC13YDL220C 2775 nt6.65□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 AVO1YOL078W 3531 nt6.65□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 GDS1YOR355W 1569 nt6.65□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 FCY2YER056C 1602 nt6.65□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 YGL072CYGL072C 360 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 RTT102YGR275W 474 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 TIM10YHR005C-A 282 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 DYS1YHR068W 1164 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 SFT1YKL006C-A 294 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 RCN2YOR220W 798 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 IRC13YOR235W 315 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 CBP3YPL215W 1008 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 RTT106YNL206C 1368 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 TIM54YJL054W 1437 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 AFG1YEL052W 1530 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 HEM1YDR232W 1647 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 MAL31YBR298C 1845 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 TFG1YGR186W 2208 nt6.64□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.63□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 YDL050CYDL050C 372 nt6.63□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 COQ4YDR204W 1008 nt6.63□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 OSW5YMR148W 447 nt6.63□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 LST8YNL006W 912 nt6.63□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 IGO1YNL157W 507 nt6.63□□□□□ -1.35
SRF1Q12516 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms