Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 VID22YLR373C 2706 nt4.62□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 TPO2YGR138C 1845 nt4.62□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 AZR1YGR224W 1842 nt4.62□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 SVF1YDR346C 1446 nt4.62□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 KEX1YGL203C 2190 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 BOP2YLR267W 1713 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YFL068WYFL068W 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 TYS1YGR185C 1185 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 DCD1YHR144C 939 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YIL152WYIL152W 708 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 COA3YJL062W-A 258 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YLR374CYLR374C 390 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YET2YMR040W 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 snR19snR19 568 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 ORC6YHR118C 1308 nt4.61□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 EXO70YJL085W 1872 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YHL049CYHL049C 816 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 CKS1YBR135W 453 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 GDH2YDL215C 3279 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 SWC3YAL011W 1878 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 MSC2YDR205W 2175 nt4.6□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 TFB3YDR460W 966 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 KRE28YDR532C 1158 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YGR015CYGR015C 987 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YIL165CYIL165C 360 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 TFA1YKL028W 1449 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 MIF2YKL089W 1650 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 RFU1YLR073C 603 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 GAD1YMR250W 1758 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 MFA2YNL145W 117 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 YOR379CYOR379C 339 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 FMP30YPL103C 1407 nt4.59□□□□□ -1.67
SPE3Q12074 BLM10YFL007W 6432 nt4.59□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 THI20YOL055C 1656 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 ENT1YDL161W 1365 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YCR050CYCR050C 309 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 LPP1YDR503C 825 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YRA2YKL214C 612 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 MFM1YPL060W 1242 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 GDT1YBR187W 843 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 HSP82YPL240C 2130 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YER158CYER158C 1722 nt4.58□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 SOF1YLL011W 1470 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 PCL9YDL179W 915 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 PIC2YER053C 903 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 NAT2YGR147C 867 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 SNL1YIL016W 480 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YKE4YIL023C 1041 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 LSO1YJR005C-A 282 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 DSC2YOL073C 969 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 LYP1YNL268W 1836 nt4.57□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 COS7YDL248W 1152 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 RNA15YGL044C 891 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 COS5YJR161C 1152 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 VTA1YLR181C 993 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 RPL15BYMR121C 615 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YPL071CYPL071C 471 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 ADY3YDL239C 2373 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 HRK1YOR267C 2280 nt4.56□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 YPL260WYPL260W 1656 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 ORM2YLR350W 651 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 POP3YNL282W 588 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 NMD3YHR170W 1557 nt4.55□□□□□ -1.68
SPE3Q12074 VBA2YBR293W 1425 nt4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49 ms