Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIRE1Q08AE8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIRE1Q08AE8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPIRE1Q08AE8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms