Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3AP98173 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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