Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GNB1P62873 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GNB1P62873 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GNB1P62873 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNB1P62873 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNB1P62873 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms