Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 33.2
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SUB1P53999 FANCG-202ENST00000425676 2108 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 PIN1-204ENST00000586025 4022 ntTSL 212.86□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DNAJC19-207ENST00000485675 1630 ntTSL 212.83□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 AGRN-204ENST00000466223 459 ntTSL 212.34□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 ASNS-208ENST00000442734 828 ntTSL 212.27□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DNAJC19-203ENST00000472504 819 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 33.2
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SUB1P53999 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DNAJC19-202ENST00000469657 1239 ntTSL 211.26□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 CYB5R3-208ENST00000470741 3938 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DYNC1H1-208ENST00000556139 763 ntTSL 311.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 ASNS-217ENST00000495255 1678 ntTSL 29.59□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 TMEM208-205ENST00000563271 614 ntTSL 29.54□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 33.2
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SUB1P53999 TMEM208-209ENST00000564649 514 ntTSL 29.32□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 PIN1-209ENST00000590540 702 ntTSL 39.18□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 PIN1-210ENST00000591777 533 ntTSL 39.01□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 TMEM208-206ENST00000563426 457 ntTSL 37.5□□□□□ -1.214e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 RAD54L-201ENST00000371975 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 33.2
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SUB1P53999 DLD-207ENST00000451081 930 ntTSL 1 (best)3.64□□□□□ -1.834e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 FNBP4-205ENST00000526109 673 ntTSL 33.47□□□□□ -1.854e-7■■■■■ 33.2
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SUB1P53999 DLD-206ENST00000450038 682 ntTSL 53□□□□□ -1.934e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 SNX14-207ENST00000503491 3491 ntTSL 22.2□□□□□ -2.064e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 SNX14-206ENST00000474645 755 ntTSL 21.88□□□□□ -2.114e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.114e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 53.67□□□□□ -1.823e-7■■■■■ 33.2
SUB1P53999 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.915e-14■■■■■ 33.1
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SUB1P53999 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-14■■■■■ 33.1
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SUB1P53999 CRYM-208ENST00000574448 1191 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 33.1
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SUB1P53999 DPH5-202ENST00000370105 2159 ntTSL 28.78□□□□□ -18e-7■■■■■ 33.1
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SUB1P53999 DPH5-208ENST00000477293 969 ntTSL 37.66□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 CRYM-203ENST00000570401 461 ntTSL 57.11□□□□□ -1.278e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-215ENST00000498372 894 ntTSL 36.77□□□□□ -1.338e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-206ENST00000466807 948 ntTSL 35.9□□□□□ -1.468e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.478e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-205ENST00000464270 1047 ntTSL 1 (best)5.21□□□□□ -1.588e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.618e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.658e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-209ENST00000481871 972 ntTSL 53.92□□□□□ -1.788e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 DPH5-207ENST00000476507 524 ntTSL 23.57□□□□□ -1.848e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 ANAPC4-207ENST00000506973 2329 ntTSL 22.49□□□□□ -2.018e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 ANAPC4-203ENST00000504256 3807 ntTSL 1 (best)1.62□□□□□ -2.158e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 REXO5-212ENST00000566993 2549 ntTSL 511.58□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 EMC1-201ENST00000375199 5408 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-13■■■■■ 33.1
SUB1P53999 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-13■■■■■ 33.1
SUB1P53999 EMC1-203ENST00000461353 2175 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-13■■■■■ 33.1
SUB1P53999 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 33.1
SUB1P53999 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.22e-13■■■■■ 33.1
SUB1P53999 EMC1-208ENST00000480380 3892 ntTSL 25.94□□□□□ -1.462e-13■■■■■ 33.1
SUB1P53999 RNF8-201ENST00000229866 2124 ntTSL 217.52■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 33.1
SUB1P53999 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 33.1
SUB1P53999 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 33.1
SUB1P53999 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.965e-15■■■■■ 33.1
SUB1P53999 NUP205-202ENST00000461255 1447 ntTSL 56.09□□□□□ -1.439e-8■■■■■ 33.1
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