Protein–RNA interactions for Protein: P33301

XRS2, DNA repair protein XRS2, yeast

Predictions only

Length 854 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	P33301	SPO20	YMR017W	1194 nt		5.01	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YIF1	YNL263C	945 nt		5.01	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YNR061C	YNR061C	660 nt		5.01	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	AIF1	YNR074C	1137 nt		5.01	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		5.01	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		5.01	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	TUB3	YML124C	1338 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	FZO1	YBR179C	2568 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	RMR1	YGL250W	726 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	ZRT1	YGL255W	1131 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YMR315W	YMR315W	1050 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	SPS4	YOR313C	1017 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	CRT10	YOL063C	2874 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	TYR1	YBR166C	1359 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	NUP116	YMR047C	3342 nt		5	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	HMS1	YOR032C	1305 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	CAF4	YKR036C	1932 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	DAS2	YDR020C	699 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	SDT1	YGL224C	843 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	ADH4	YGL256W	1149 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	WSS1	YHR134W	810 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YMR084W	YMR084W	789 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	RCL1	YOL010W	1104 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YGR125W	YGR125W	3111 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	LAS21	YJL062W	2493 nt		4.99	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	NPL4	YBR170C	1743 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	KCC4	YCL024W	3114 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	SWI3	YJL176C	2478 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	ACT1	YFL039C	1128 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	CPR3	YML078W	549 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	SAP30	YMR263W	606 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	ATM1	YMR301C	2073 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	MEF2	YJL102W	2460 nt		4.98	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	TDA6	YPR157W	1404 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	RAD28	YDR030C	1521 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YDL027C	YDL027C	1263 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	ARF2	YDL137W	546 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YGL193C	YGL193C	312 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	NMA1	YLR328W	1206 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	RAD10	YML095C	633 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	MRP21	YBL090W	534 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	SHE3	YBR130C	1278 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	NGL3	YML118W	1518 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	CLB5	YPR120C	1308 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	ABF1	YKL112W	2196 nt		4.97	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	YMR1	YJR110W	2067 nt		4.96	□□□□□ -1.61
XRS2	P33301	POP6	YGR030C	477 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	VMA22	YHR060W	546 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	TFA2	YKR062W	987 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	HIS4	YCL030C	2400 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	POL12	YBL035C	2118 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	IPI3	YNL182C	1668 nt		4.96	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	ECM32	YER176W	3366 nt		4.95	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YDR222W	YDR222W	1248 nt		4.95	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YGR016W	YGR016W	573 nt		4.95	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	UMP1	YBR173C	447 nt		4.95	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	LEU1	YGL009C	2340 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	MAF1	YDR005C	1188 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	AIM39	YOL053W	1188 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	MED7	YOL135C	669 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	CNS1	YBR155W	1158 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	PSY4	YBL046W	1326 nt		4.94	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	HIR2	YOR038C	2628 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	snR78	snR78	87 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	TYW3	YGL050W	822 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YJL220W	YJL220W	453 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	RPP0	YLR340W	939 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	MDM38	YOL027C	1722 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	VPS21	YOR089C	633 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.93	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	GPB1	YOR371C	2694 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YFT2	YDR319C	825 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YDR336W	YDR336W	945 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	SNA2	YDR525W-A	240 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	CYC1	YJR048W	330 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	SIF2	YBR103W	1608 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	SUL2	YLR092W	2682 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	SRO9	YCL037C	1305 nt		4.92	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	ENT1	YDL161W	1365 nt		4.91	□□□□□ -1.62
XRS2	P33301	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.1 ms