Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA6P31267 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA6P31267 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms