Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCTD3Q9Y597 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCTD3Q9Y597 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms