Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NECAP2Q9NVZ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NECAP2Q9NVZ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms