Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PREBQ9HCU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms