Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNI3KQ59H18 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNI3KQ59H18 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms