Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 VPS21YOR089C 633 nt6.78□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 TUF1YOR187W 1314 nt6.77□□□□□ -1.32
SRF1Q12516 CLN1YMR199W 1641 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 GPI11YDR302W 660 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 UTR4YEL038W 684 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 RPL22BYFL034C-A 369 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 TWF1YGR080W 999 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 MEH1YKR007W 555 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YML131WYML131W 1098 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 BBP1YPL255W 1158 nt6.77□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 RRB1YMR131C 1536 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 TDP1YBR223C 1635 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 INO2YDR123C 915 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 CAF16YFL028C 870 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YKL031WYKL031W 414 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 COS9YKL219W 1224 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 COX7YMR256C 183 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 BUD17YNR027W 954 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 UAF30YOR295W 687 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 MLF3YNL074C 1359 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 GEF1YJR040W 2340 nt6.76□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 TMA64YDR117C 1698 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 FKH1YIL131C 1455 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 CDC34YDR054C 888 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 CTH1YDR151C 978 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 GIR2YDR152W 798 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 QCR6YFR033C 444 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 HOP2YGL033W 657 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YNK1YKL067W 462 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YLR217WYLR217W 324 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 MUP3YHL036W 1641 nt6.75□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 SPT14YPL175W 1359 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 GNA1YFL017C 480 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 BIG1YHR101C 1008 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YKL023WYKL023W 834 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 RPS31YLR167W 459 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 SPS19YNL202W 879 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 STT3YGL022W 2157 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 MSS1YMR023C 1581 nt6.74□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 CNE1YAL058W 1509 nt6.73□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 RPL13AYDL082W 600 nt6.73□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 COX20YDR231C 618 nt6.73□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 SAM37YMR060C 984 nt6.73□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 ADD37YMR184W 597 nt6.73□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 MEI5YPL121C 669 nt6.73□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 ILV1YER086W 1731 nt6.73□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 NTE1YML059C 5040 nt6.72□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 TSC13YDL015C 933 nt6.72□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 snR7-LsnR7-L 214 nt6.72□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 GLG2YJL137C 1143 nt6.72□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 SFH5YJL145W 885 nt6.72□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 ELO3YLR372W 1038 nt6.72□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 PLP2YOR281C 861 nt6.72□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 PRR2YDL214C 2100 nt6.71□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 NTA1YJR062C 1374 nt6.71□□□□□ -1.33
SRF1Q12516 YDR203WYDR203W 318 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YGR182CYGR182C 354 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 RTA1YGR213C 954 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 RFC2YJR068W 1062 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 DAN1YJR150C 897 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MRT4YKL009W 711 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YML084WYML084W 309 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 WRS1YOL097C 1299 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YBR012CYBR012C 420 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MRPL37YBR268W 318 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 EXG2YDR261C 1689 nt6.71□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 AVT5YBL089W 1380 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 HXT15YDL245C 1704 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 HXT7YDR342C 1713 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 HXT6YDR343C 1713 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 HXT16YJR158W 1704 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PEX10YDR265W 1014 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 KRE9YJL174W 831 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YKL083WYKL083W 615 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YML083CYML083C 1257 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YOR029WYOR029W 336 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 IAH1YOR126C 717 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PYK2YOR347C 1521 nt6.7□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 LTV1YKL143W 1392 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 GCD10YNL062C 1437 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PHO3YBR092C 1404 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 RPL24AYGL031C 468 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 PUS6YGR169C 1215 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SOL3YHR163W 750 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 VPS25YJR102C 609 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YOR289WYOR289W 756 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 YPL264CYPL264C 1062 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 ANT1YPR128C 987 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 POL30YBR088C 777 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 EDE1YBL047C 4146 nt6.69□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 SLX5YDL013W 1860 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 AMD2YDR242W 1650 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 XBP1YIL101C 1944 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 FET3YMR058W 1911 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 NUP84YDL116W 2181 nt6.68□□□□□ -1.34
SRF1Q12516 MKS1YNL076W 1755 nt6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.9 ms