Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 SDH3YKL141W 597 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YLR049CYLR049C 1287 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YHC1YLR298C 696 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YMR010WYMR010W 1218 nt5.95□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 CCS1YMR038C 750 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SHE1YBL031W 1017 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 CCL1YPR025C 1182 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 ANT1YPR128C 987 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 TRS20YBR254C 528 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 REF2YDR195W 1602 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 GUP2YPL189W 1830 nt5.95□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 CRZ1YNL027W 2037 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 RGL1YPL066W 1440 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SCM3YDL139C 672 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 NUP42YDR192C 1293 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SRB5YGR104C 924 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SYS1YJL004C 612 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 CDC123YLR215C 1083 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YML131WYML131W 1098 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 OSW5YMR148W 447 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 GIP2YER054C 1647 nt5.94□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 SUP45YBR143C 1314 nt5.94□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 PTK2YJR059W 2457 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YMR155WYMR155W 1644 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 DDC1YPL194W 1839 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YCL065WYCL065W 369 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YRA1YDR381W 681 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YGR042WYGR042W 816 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YGR111WYGR111W 1203 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 FOL2YGR267C 732 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 GEP5YLR091W 882 nt5.93□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YLR339CYLR339C 552 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YBL071CYBL071C 309 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MPD2YOL088C 834 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YOR289WYOR289W 756 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 LAS1YKR063C 1509 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 PST1YDR055W 1335 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 AMA1YGR225W 1782 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MLF3YNL074C 1359 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 VMS1YDR049W 1899 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 LSG1YGL099W 1923 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 GYP1YOR070C 1914 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SLM5YCR024C 1479 nt5.92□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 GLC7YER133W 939 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SIP2YGL208W 1248 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 TAD1YGL243W 1203 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 ASK1YKL052C 879 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MRP49YKL167C 414 nt5.92□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 YKR073CYKR073C 321 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MID2YLR332W 1131 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 GPI12YMR281W 915 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 RPS15YOL040C 429 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 UIP4YPL186C 915 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 BBP1YPL255W 1158 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 BSD2YBR290W 966 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 ALD6YPL061W 1503 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 SSK22YCR073C 3996 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 ART10YLR392C 1557 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 PUF3YLL013C 2640 nt5.91□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 PRS1YKL181W 1284 nt5.91□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 PNO1YOR145C 825 nt5.91□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MRP2YPR166C 348 nt5.91□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF3Q07807 GEX2YKR106W 1848 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 AVO1YOL078W 3531 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MDH3YDL078C 1032 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 RCR2YDR003W 633 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 CNN1YFR046C 1086 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 PAN6YIL145C 930 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MNN11YJL183W 1269 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 MTD1YKR080W 963 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 PRM9YAR031W 897 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 ATP19YOL077W-A 207 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF3Q07807 ENT2YLR206W 1842 nt5.9□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 LAP2YNL045W 2016 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SNM1YDR478W 597 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 HTD2YHR067W 843 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YJL218WYJL218W 591 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YJR071WYJR071W 369 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 GCD7YLR291C 1146 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YCL007CYCL007C 393 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MGA1YGR249W 1371 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 AAP1YHR047C 2571 nt5.88□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF3Q07807 FET3YMR058W 1911 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 STE13YOR219C 2796 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 ELO2YCR034W 1044 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 RPL27AYHR010W 411 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 CIC1YHR052W 1131 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 RFC2YJR068W 1062 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SFC1YJR095W 969 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 KTI12YKL110C 942 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SPC3YLR066W 555 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 ITT1YML068W 1395 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MAL13YGR288W 1422 nt5.88□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF3Q07807 PHO12YHR215W 1404 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 PHO11YAR071W 1404 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MKC7YDR144C 1791 nt5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.1 ms