Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD8P48556 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD8P48556 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD8P48556 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms