Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR7P32248 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR7P32248 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR7P32248 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR7P32248 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR7P32248 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR7P32248 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR7P32248 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR7P32248 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR7P32248 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR7P32248 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR7P32248 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR7P32248 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR7P32248 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR7P32248 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR7P32248 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR7P32248 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR7P32248 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR7P32248 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR7P32248 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR7P32248 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR7P32248 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR7P32248 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR7P32248 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR7P32248 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR7P32248 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR7P32248 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR7P32248 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR7P32248 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR7P32248 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR7P32248 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR7P32248 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR7P32248 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR7P32248 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR7P32248 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR7P32248 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR7P32248 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCR7P32248 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms