Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC5P28715 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms