Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME2P22392 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME2P22392 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME2P22392 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME2P22392 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME2P22392 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME2P22392 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME2P22392 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME2P22392 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME2P22392 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME2P22392 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME2P22392 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME2P22392 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NME2P22392 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME2P22392 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME2P22392 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME2P22392 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME2P22392 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME2P22392 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NME2P22392 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NME2P22392 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms