Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NCK1P16333 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCK1P16333 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCK1P16333 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCK1P16333 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCK1P16333 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCK1P16333 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCK1P16333 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCK1P16333 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCK1P16333 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NCK1P16333 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCK1P16333 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCK1P16333 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCK1P16333 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms