Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF3O75054 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms