Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCRIPO60506 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNCRIPO60506 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms