Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB2O43679 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB2O43679 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB2O43679 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB2O43679 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB2O43679 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB2O43679 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB2O43679 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB2O43679 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB2O43679 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB2O43679 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB2O43679 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB2O43679 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB2O43679 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB2O43679 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB2O43679 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB2O43679 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDB2O43679 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDB2O43679 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDB2O43679 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB2O43679 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms