Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAD1O00515 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAD1O00515 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAD1O00515 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAD1O00515 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAD1O00515 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAD1O00515 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAD1O00515 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAD1O00515 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAD1O00515 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAD1O00515 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAD1O00515 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAD1O00515 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAD1O00515 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAD1O00515 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAD1O00515 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LAD1O00515 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAD1O00515 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAD1O00515 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAD1O00515 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAD1O00515 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAD1O00515 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LAD1O00515 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LAD1O00515 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LAD1O00515 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAD1O00515 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAD1O00515 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAD1O00515 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAD1O00515 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAD1O00515 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAD1O00515 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LAD1O00515 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAD1O00515 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAD1O00515 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAD1O00515 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms