Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 TAD3YLR316C 969 nt12.2□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 LYS4YDR234W 2082 nt12.19□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 YFL067WYFL067W 528 nt12.19□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 UBX6YJL048C 1191 nt12.19□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 CRR1YLR213C 1269 nt12.19□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 PTK1YKL198C 1989 nt12.18□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 DDR2YOL052C-A 186 nt12.17□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 YDR094WYDR094W 336 nt12.15□□□□□ -0.46
SMC6Q12749 STB1YNL309W 1263 nt12.14□□□□□ -0.47
SMC6Q12749 SPC25YER018C 666 nt12.12□□□□□ -0.47
SMC6Q12749 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.1□□□□□ -0.47
SMC6Q12749 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.1□□□□□ -0.47
SMC6Q12749 HEM12YDR047W 1089 nt12.08□□□□□ -0.48
SMC6Q12749 SNG1YGR197C 1644 nt12.08□□□□□ -0.48
SMC6Q12749 GPI16YHR188C 1833 nt12.07□□□□□ -0.48
SMC6Q12749 CCT4YDL143W 1587 nt12.07□□□□□ -0.48
SMC6Q12749 BOR1YNL275W 1731 nt12.06□□□□□ -0.48
SMC6Q12749 MIC10YCL057C-A 294 nt12.05□□□□□ -0.48
SMC6Q12749 ANP1YEL036C 1503 nt12.04□□□□□ -0.48
SMC6Q12749 VPS60YDR486C 690 nt12.02□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 FEN2YCR028C 1539 nt12.01□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 YFR018CYFR018C 1092 nt12□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 BDH1YAL060W 1149 nt12□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 SWC5YBR231C 912 nt11.99□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 UME6YDR207C 2511 nt11.97□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 YLR415CYLR415C 339 nt11.97□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 ALG3YBL082C 1377 nt11.96□□□□□ -0.49
SMC6Q12749 YFL054CYFL054C 1941 nt11.96□□□□□ -0.5
SMC6Q12749 YSP3YOR003W 1437 nt11.94□□□□□ -0.5
SMC6Q12749 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.93□□□□□ -0.5
SMC6Q12749 YIR016WYIR016W 798 nt11.91□□□□□ -0.5
SMC6Q12749 PRE6YOL038W 765 nt11.91□□□□□ -0.5
SMC6Q12749 PEX25YPL112C 1185 nt11.91□□□□□ -0.5
SMC6Q12749 YFL066CYFL066C 1179 nt11.89□□□□□ -0.51
SMC6Q12749 RRT5YFR032C 870 nt11.89□□□□□ -0.51
SMC6Q12749 YNL115CYNL115C 1935 nt11.87□□□□□ -0.51
SMC6Q12749 SPT8YLR055C 1809 nt11.86□□□□□ -0.51
SMC6Q12749 BNA2YJR078W 1362 nt11.85□□□□□ -0.51
SMC6Q12749 PAU16YKL224C 372 nt11.85□□□□□ -0.51
SMC6Q12749 RAX1YOR301W 1308 nt11.85□□□□□ -0.51
SMC6Q12749 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.8□□□□□ -0.52
SMC6Q12749 MIC12YBR262C 321 nt11.8□□□□□ -0.52
SMC6Q12749 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.76□□□□□ -0.53
SMC6Q12749 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.76□□□□□ -0.53
SMC6Q12749 VPS75YNL246W 795 nt11.72□□□□□ -0.53
SMC6Q12749 TIM17YJL143W 477 nt11.71□□□□□ -0.53
SMC6Q12749 XDJ1YLR090W 1380 nt11.7□□□□□ -0.54
SMC6Q12749 HHO1YPL127C 777 nt11.7□□□□□ -0.54
SMC6Q12749 SHM2YLR058C 1410 nt11.69□□□□□ -0.54
SMC6Q12749 SWE1YJL187C 2460 nt11.68□□□□□ -0.54
SMC6Q12749 HSP60YLR259C 1719 nt11.66□□□□□ -0.54
SMC6Q12749 YGR201CYGR201C 678 nt11.66□□□□□ -0.54
SMC6Q12749 GDH3YAL062W 1374 nt11.64□□□□□ -0.55
SMC6Q12749 CCA1YER168C 1641 nt11.64□□□□□ -0.55
SMC6Q12749 MCH5YOR306C 1566 nt11.62□□□□□ -0.55
SMC6Q12749 ALG12YNR030W 1656 nt11.62□□□□□ -0.55
SMC6Q12749 GLK1YCL040W 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
SMC6Q12749 NAT4YMR069W 858 nt11.59□□□□□ -0.55
SMC6Q12749 MIR1YJR077C 936 nt11.58□□□□□ -0.56
SMC6Q12749 AGP1YCL025C 1902 nt11.57□□□□□ -0.56
SMC6Q12749 NIT1YIL164C 600 nt11.57□□□□□ -0.56
SMC6Q12749 PAU7YAR020C 168 nt11.57□□□□□ -0.56
SMC6Q12749 AVT6YER119C 1347 nt11.55□□□□□ -0.56
SMC6Q12749 SGT2YOR007C 1041 nt11.54□□□□□ -0.56
SMC6Q12749 THI74YDR438W 1113 nt11.53□□□□□ -0.56
SMC6Q12749 GOR1YNL274C 1053 nt11.52□□□□□ -0.57
SMC6Q12749 MSF1YPR047W 1410 nt11.5□□□□□ -0.57
SMC6Q12749 DUT1YBR252W 444 nt11.48□□□□□ -0.57
SMC6Q12749 SHB17YKR043C 816 nt11.45□□□□□ -0.58
SMC6Q12749 DAT1YML113W 747 nt11.45□□□□□ -0.58
SMC6Q12749 UBA4YHR111W 1323 nt11.42□□□□□ -0.58
SMC6Q12749 DUS1YML080W 1272 nt11.42□□□□□ -0.58
SMC6Q12749 YDR010CYDR010C 333 nt11.4□□□□□ -0.58
SMC6Q12749 YCR102CYCR102C 1107 nt11.38□□□□□ -0.59
SMC6Q12749 SBA1YKL117W 651 nt11.35□□□□□ -0.59
SMC6Q12749 YSR3YKR053C 1215 nt11.35□□□□□ -0.59
SMC6Q12749 YGL034CYGL034C 366 nt11.34□□□□□ -0.59
SMC6Q12749 YCL074WYCL074W 927 nt11.33□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 RET2YFR051C 1641 nt11.32□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 STR3YGL184C 1398 nt11.32□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 FUR4YBR021W 1902 nt11.31□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 PHO89YBR296C 1725 nt11.3□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.28□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.28□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 AQY2YLL052C 450 nt11.28□□□□□ -0.6
SMC6Q12749 NBP35YGL091C 987 nt11.27□□□□□ -0.61
SMC6Q12749 XYL2YLR070C 1071 nt11.27□□□□□ -0.61
SMC6Q12749 NAR1YNL240C 1476 nt11.25□□□□□ -0.61
SMC6Q12749 YCR087WYCR087W 516 nt11.24□□□□□ -0.61
SMC6Q12749 AAC1YMR056C 930 nt11.24□□□□□ -0.61
SMC6Q12749 PRP4YPR178W 1398 nt11.23□□□□□ -0.61
SMC6Q12749 SFA1YDL168W 1161 nt11.21□□□□□ -0.61
SMC6Q12749 TIR3YIL011W 810 nt11.19□□□□□ -0.62
SMC6Q12749 MRP20YDR405W 792 nt11.18□□□□□ -0.62
SMC6Q12749 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.18□□□□□ -0.62
SMC6Q12749 RBG1YAL036C 1110 nt11.18□□□□□ -0.62
SMC6Q12749 SHH4YLR164W 507 nt11.17□□□□□ -0.62
SMC6Q12749 COQ2YNR041C 1119 nt11.17□□□□□ -0.62
SMC6Q12749 AIM45YPR004C 1035 nt11.17□□□□□ -0.62
SMC6Q12749 DPS1YLL018C 1674 nt11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms