Protein–RNA interactions for Protein: Q12488

PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF1Q12488 AHT1YHR093W 549 nt10.09□□□□□ -0.79
PSF1Q12488 CRR1YLR213C 1269 nt10.09□□□□□ -0.79
PSF1Q12488 LYS4YDR234W 2082 nt10.09□□□□□ -0.79
PSF1Q12488 YFL067WYFL067W 528 nt10.08□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 UME6YDR207C 2511 nt10.08□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 ATF2YGR177C 1608 nt10.07□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.06□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 TAD3YLR316C 969 nt10.05□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 DDR2YOL052C-A 186 nt10.04□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.03□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.03□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 SWE1YJL187C 2460 nt10.02□□□□□ -0.8
PSF1Q12488 SPC25YER018C 666 nt10.02□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 STB1YNL309W 1263 nt10.01□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 HSP60YLR259C 1719 nt10□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.99□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 HEM12YDR047W 1089 nt9.99□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.99□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 GPI16YHR188C 1833 nt9.98□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 SNG1YGR197C 1644 nt9.97□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 YDR094WYDR094W 336 nt9.97□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 ANP1YEL036C 1503 nt9.97□□□□□ -0.81
PSF1Q12488 CCT4YDL143W 1587 nt9.95□□□□□ -0.82
PSF1Q12488 UBX6YJL048C 1191 nt9.94□□□□□ -0.82
PSF1Q12488 MIC10YCL057C-A 294 nt9.94□□□□□ -0.82
PSF1Q12488 FEN2YCR028C 1539 nt9.92□□□□□ -0.82
PSF1Q12488 VPS60YDR486C 690 nt9.91□□□□□ -0.82
PSF1Q12488 SWC5YBR231C 912 nt9.89□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 GLK1YCL040W 1503 nt9.88□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.88□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 BDH1YAL060W 1149 nt9.88□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 YFR018CYFR018C 1092 nt9.87□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 YLR415CYLR415C 339 nt9.87□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 MCH5YOR306C 1566 nt9.85□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 ALG12YNR030W 1656 nt9.85□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 ALG3YBL082C 1377 nt9.85□□□□□ -0.83
PSF1Q12488 YSP3YOR003W 1437 nt9.83□□□□□ -0.84
PSF1Q12488 YIR016WYIR016W 798 nt9.82□□□□□ -0.84
PSF1Q12488 PEX25YPL112C 1185 nt9.81□□□□□ -0.84
PSF1Q12488 RAX1YOR301W 1308 nt9.81□□□□□ -0.84
PSF1Q12488 BNA2YJR078W 1362 nt9.79□□□□□ -0.84
PSF1Q12488 FUR4YBR021W 1902 nt9.78□□□□□ -0.84
PSF1Q12488 YNL115CYNL115C 1935 nt9.76□□□□□ -0.85
PSF1Q12488 RRT5YFR032C 870 nt9.76□□□□□ -0.85
PSF1Q12488 MIC12YBR262C 321 nt9.76□□□□□ -0.85
PSF1Q12488 PRE6YOL038W 765 nt9.75□□□□□ -0.85
PSF1Q12488 YFL066CYFL066C 1179 nt9.73□□□□□ -0.85
PSF1Q12488 PAU16YKL224C 372 nt9.72□□□□□ -0.85
PSF1Q12488 PRP4YPR178W 1398 nt9.69□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 YGR201CYGR201C 678 nt9.67□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 TIM17YJL143W 477 nt9.67□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 VPS75YNL246W 795 nt9.67□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.66□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 AAC1YMR056C 930 nt9.66□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 HHO1YPL127C 777 nt9.66□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 CCA1YER168C 1641 nt9.66□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 XDJ1YLR090W 1380 nt9.65□□□□□ -0.86
PSF1Q12488 NAR1YNL240C 1476 nt9.63□□□□□ -0.87
PSF1Q12488 SHM2YLR058C 1410 nt9.63□□□□□ -0.87
PSF1Q12488 DPS1YLL018C 1674 nt9.62□□□□□ -0.87
PSF1Q12488 GDH3YAL062W 1374 nt9.6□□□□□ -0.87
PSF1Q12488 BMT6YLR063W 1098 nt9.59□□□□□ -0.87
PSF1Q12488 AGP1YCL025C 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
PSF1Q12488 NIT1YIL164C 600 nt9.54□□□□□ -0.88
PSF1Q12488 MIR1YJR077C 936 nt9.54□□□□□ -0.88
PSF1Q12488 AVT6YER119C 1347 nt9.53□□□□□ -0.88
PSF1Q12488 PAU7YAR020C 168 nt9.52□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 NAT4YMR069W 858 nt9.52□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 YKR005CYKR005C 1578 nt9.51□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 GOR1YNL274C 1053 nt9.51□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 SGT2YOR007C 1041 nt9.51□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 BIO5YNR056C 1686 nt9.5□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 DAT1YML113W 747 nt9.49□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 THI74YDR438W 1113 nt9.48□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 DUS1YML080W 1272 nt9.47□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 SNF1YDR477W 1902 nt9.46□□□□□ -0.89
PSF1Q12488 RPM1RPM1 483 nt9.46□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 MSF1YPR047W 1410 nt9.46□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 DUT1YBR252W 444 nt9.44□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 SHB17YKR043C 816 nt9.43□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 YGR259CYGR259C 441 nt9.42□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 UBA4YHR111W 1323 nt9.4□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 YCL074WYCL074W 927 nt9.4□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 YCR102CYCR102C 1107 nt9.4□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 CYT2YKL087C 675 nt9.4□□□□□ -0.9
PSF1Q12488 YDR010CYDR010C 333 nt9.39□□□□□ -0.91
PSF1Q12488 PBP1YGR178C 2169 nt9.38□□□□□ -0.91
PSF1Q12488 IRC24YIR036C 792 nt9.36□□□□□ -0.91
PSF1Q12488 STR3YGL184C 1398 nt9.35□□□□□ -0.91
PSF1Q12488 RET2YFR051C 1641 nt9.34□□□□□ -0.91
PSF1Q12488 YSR3YKR053C 1215 nt9.33□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.32□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.32□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 CMP2YML057W 1815 nt9.31□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 YGL034CYGL034C 366 nt9.31□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 NBP35YGL091C 987 nt9.31□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 AQY2YLL052C 450 nt9.3□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 YCR087WYCR087W 516 nt9.29□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 PHO89YBR296C 1725 nt9.28□□□□□ -0.92
PSF1Q12488 SBA1YKL117W 651 nt9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45 ms