Protein–RNA interactions for Protein: Q12348

RRI2, COP9 signalosome complex subunit 10, yeastyeast

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI2Q12348 PRE6YOL038W 765 nt12.99□□□□□ -0.33
RRI2Q12348 RRT5YFR032C 870 nt12.98□□□□□ -0.33
RRI2Q12348 STB1YNL309W 1263 nt12.98□□□□□ -0.33
RRI2Q12348 ATF2YGR177C 1608 nt12.98□□□□□ -0.33
RRI2Q12348 YFL067WYFL067W 528 nt12.96□□□□□ -0.33
RRI2Q12348 BDH1YAL060W 1149 nt12.96□□□□□ -0.33
RRI2Q12348 CRR1YLR213C 1269 nt12.95□□□□□ -0.34
RRI2Q12348 DDR2YOL052C-A 186 nt12.93□□□□□ -0.34
RRI2Q12348 CCT4YDL143W 1587 nt12.93□□□□□ -0.34
RRI2Q12348 YSP3YOR003W 1437 nt12.92□□□□□ -0.34
RRI2Q12348 PEX25YPL112C 1185 nt12.92□□□□□ -0.34
RRI2Q12348 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.91□□□□□ -0.34
RRI2Q12348 GPI16YHR188C 1833 nt12.9□□□□□ -0.34
RRI2Q12348 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.89□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 BOP3YNL042W 1191 nt12.89□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 YFL066CYFL066C 1179 nt12.88□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 YLR415CYLR415C 339 nt12.88□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 LYS4YDR234W 2082 nt12.86□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 VPS60YDR486C 690 nt12.85□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 RTF1YGL244W 1677 nt12.85□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 PIB2YGL023C 1908 nt12.84□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 ANP1YEL036C 1503 nt12.84□□□□□ -0.35
RRI2Q12348 YNL115CYNL115C 1935 nt12.83□□□□□ -0.36
RRI2Q12348 SWC5YBR231C 912 nt12.82□□□□□ -0.36
RRI2Q12348 SNG1YGR197C 1644 nt12.81□□□□□ -0.36
RRI2Q12348 FEN2YCR028C 1539 nt12.81□□□□□ -0.36
RRI2Q12348 ALG3YBL082C 1377 nt12.8□□□□□ -0.36
RRI2Q12348 HEM12YDR047W 1089 nt12.79□□□□□ -0.36
RRI2Q12348 MIC10YCL057C-A 294 nt12.76□□□□□ -0.37
RRI2Q12348 YIR016WYIR016W 798 nt12.69□□□□□ -0.38
RRI2Q12348 VPS75YNL246W 795 nt12.69□□□□□ -0.38
RRI2Q12348 SPT8YLR055C 1809 nt12.69□□□□□ -0.38
RRI2Q12348 SBA1YKL117W 651 nt12.66□□□□□ -0.38
RRI2Q12348 NAT4YMR069W 858 nt12.66□□□□□ -0.38
RRI2Q12348 PTK1YKL198C 1989 nt12.66□□□□□ -0.38
RRI2Q12348 MIR1YJR077C 936 nt12.62□□□□□ -0.39
RRI2Q12348 GLK1YCL040W 1503 nt12.62□□□□□ -0.39
RRI2Q12348 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.6□□□□□ -0.39
RRI2Q12348 YJL225CYJL225C 5277 nt12.58□□□□□ -0.4
RRI2Q12348 MSF1YPR047W 1410 nt12.56□□□□□ -0.4
RRI2Q12348 THI74YDR438W 1113 nt12.55□□□□□ -0.4
RRI2Q12348 TIM17YJL143W 477 nt12.55□□□□□ -0.4
RRI2Q12348 MIC12YBR262C 321 nt12.54□□□□□ -0.4
RRI2Q12348 BNA2YJR078W 1362 nt12.51□□□□□ -0.41
RRI2Q12348 RAX1YOR301W 1308 nt12.5□□□□□ -0.41
RRI2Q12348 SHM2YLR058C 1410 nt12.5□□□□□ -0.41
RRI2Q12348 XDJ1YLR090W 1380 nt12.49□□□□□ -0.41
RRI2Q12348 PAU7YAR020C 168 nt12.45□□□□□ -0.42
RRI2Q12348 YFL054CYFL054C 1941 nt12.44□□□□□ -0.42
RRI2Q12348 DAT1YML113W 747 nt12.43□□□□□ -0.42
RRI2Q12348 YGR201CYGR201C 678 nt12.41□□□□□ -0.42
RRI2Q12348 NIT1YIL164C 600 nt12.4□□□□□ -0.42
RRI2Q12348 GDH3YAL062W 1374 nt12.4□□□□□ -0.42
RRI2Q12348 HHO1YPL127C 777 nt12.39□□□□□ -0.43
RRI2Q12348 SHB17YKR043C 816 nt12.38□□□□□ -0.43
RRI2Q12348 UBA4YHR111W 1323 nt12.37□□□□□ -0.43
RRI2Q12348 SGT2YOR007C 1041 nt12.37□□□□□ -0.43
RRI2Q12348 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.34□□□□□ -0.43
RRI2Q12348 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.34□□□□□ -0.43
RRI2Q12348 YDR010CYDR010C 333 nt12.32□□□□□ -0.44
RRI2Q12348 YGL034CYGL034C 366 nt12.32□□□□□ -0.44
RRI2Q12348 YSR3YKR053C 1215 nt12.28□□□□□ -0.44
RRI2Q12348 AVT6YER119C 1347 nt12.26□□□□□ -0.45
RRI2Q12348 RET2YFR051C 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
RRI2Q12348 CCA1YER168C 1641 nt12.23□□□□□ -0.45
RRI2Q12348 AGP1YCL025C 1902 nt12.22□□□□□ -0.45
RRI2Q12348 YMR244WYMR244W 1068 nt12.22□□□□□ -0.45
RRI2Q12348 SWE1YJL187C 2460 nt12.21□□□□□ -0.45
RRI2Q12348 XYL2YLR070C 1071 nt12.2□□□□□ -0.46
RRI2Q12348 GOR1YNL274C 1053 nt12.2□□□□□ -0.46
RRI2Q12348 PHO89YBR296C 1725 nt12.18□□□□□ -0.46
RRI2Q12348 GLR1YPL091W 1452 nt12.17□□□□□ -0.46
RRI2Q12348 YCR087WYCR087W 516 nt12.17□□□□□ -0.46
RRI2Q12348 DUT1YBR252W 444 nt12.15□□□□□ -0.46
RRI2Q12348 YCR102CYCR102C 1107 nt12.14□□□□□ -0.47
RRI2Q12348 NDI1YML120C 1542 nt12.14□□□□□ -0.47
RRI2Q12348 RBG1YAL036C 1110 nt12.12□□□□□ -0.47
RRI2Q12348 AIM45YPR004C 1035 nt12.11□□□□□ -0.47
RRI2Q12348 SFA1YDL168W 1161 nt12.05□□□□□ -0.48
RRI2Q12348 COQ2YNR041C 1119 nt12.05□□□□□ -0.48
RRI2Q12348 MRP20YDR405W 792 nt12.03□□□□□ -0.48
RRI2Q12348 NBP35YGL091C 987 nt12.02□□□□□ -0.49
RRI2Q12348 RBG2YGR173W 1107 nt12□□□□□ -0.49
RRI2Q12348 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.97□□□□□ -0.49
RRI2Q12348 DUS1YML080W 1272 nt11.97□□□□□ -0.49
RRI2Q12348 TIR3YIL011W 810 nt11.96□□□□□ -0.49
RRI2Q12348 PAC11YDR488C 1602 nt11.96□□□□□ -0.5
RRI2Q12348 STR3YGL184C 1398 nt11.95□□□□□ -0.5
RRI2Q12348 SHH4YLR164W 507 nt11.94□□□□□ -0.5
RRI2Q12348 YMR226CYMR226C 804 nt11.93□□□□□ -0.5
RRI2Q12348 RPL4BYDR012W 1089 nt11.91□□□□□ -0.5
RRI2Q12348 RPL4AYBR031W 1089 nt11.91□□□□□ -0.5
RRI2Q12348 YCL074WYCL074W 927 nt11.9□□□□□ -0.5
RRI2Q12348 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.89□□□□□ -0.51
RRI2Q12348 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.89□□□□□ -0.51
RRI2Q12348 AQY2YLL052C 450 nt11.87□□□□□ -0.51
RRI2Q12348 CLB6YGR109C 1143 nt11.86□□□□□ -0.51
RRI2Q12348 LSC2YGR244C 1284 nt11.85□□□□□ -0.51
RRI2Q12348 RPS14BYJL191W 417 nt11.85□□□□□ -0.51
RRI2Q12348 POM34YLR018C 900 nt11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.6 ms