Protein–RNA interactions for Protein: Q12301

YDL180W, Uncharacterized membrane protein YDL180W, yeastyeast

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL180WQ12301 TRM5YHR070W 1500 nt9.61□□□□□ -0.87
YDL180WQ12301 YFL067WYFL067W 528 nt9.61□□□□□ -0.87
YDL180WQ12301 CRR1YLR213C 1269 nt9.6□□□□□ -0.87
YDL180WQ12301 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.6□□□□□ -0.87
YDL180WQ12301 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.6□□□□□ -0.87
YDL180WQ12301 ATF2YGR177C 1608 nt9.58□□□□□ -0.88
YDL180WQ12301 DDR2YOL052C-A 186 nt9.58□□□□□ -0.88
YDL180WQ12301 SPC25YER018C 666 nt9.57□□□□□ -0.88
YDL180WQ12301 STB1YNL309W 1263 nt9.57□□□□□ -0.88
YDL180WQ12301 GPI16YHR188C 1833 nt9.54□□□□□ -0.88
YDL180WQ12301 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.54□□□□□ -0.88
YDL180WQ12301 YFR018CYFR018C 1092 nt9.54□□□□□ -0.88
YDL180WQ12301 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.52□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 CCT4YDL143W 1587 nt9.52□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 LYS4YDR234W 2082 nt9.52□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 PTK1YKL198C 1989 nt9.52□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 HEM12YDR047W 1089 nt9.5□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 ANP1YEL036C 1503 nt9.49□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 BDH1YAL060W 1149 nt9.48□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 SNG1YGR197C 1644 nt9.48□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 YLR415CYLR415C 339 nt9.47□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 SWC5YBR231C 912 nt9.47□□□□□ -0.89
YDL180WQ12301 VPS60YDR486C 690 nt9.46□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 RRT5YFR032C 870 nt9.46□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 PEX25YPL112C 1185 nt9.45□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 FEN2YCR028C 1539 nt9.45□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 YSP3YOR003W 1437 nt9.44□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 MIC10YCL057C-A 294 nt9.43□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 PAU16YKL224C 372 nt9.41□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 ALG3YBL082C 1377 nt9.4□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.4□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 PRE6YOL038W 765 nt9.4□□□□□ -0.9
YDL180WQ12301 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.38□□□□□ -0.91
YDL180WQ12301 YNL115CYNL115C 1935 nt9.37□□□□□ -0.91
YDL180WQ12301 YFL066CYFL066C 1179 nt9.36□□□□□ -0.91
YDL180WQ12301 YIR016WYIR016W 798 nt9.36□□□□□ -0.91
YDL180WQ12301 BNA2YJR078W 1362 nt9.33□□□□□ -0.92
YDL180WQ12301 SPT8YLR055C 1809 nt9.33□□□□□ -0.92
YDL180WQ12301 YFL054CYFL054C 1941 nt9.32□□□□□ -0.92
YDL180WQ12301 VPS75YNL246W 795 nt9.31□□□□□ -0.92
YDL180WQ12301 RAX1YOR301W 1308 nt9.31□□□□□ -0.92
YDL180WQ12301 Q0182Q0182 405 nt9.29□□□□□ -0.92
YDL180WQ12301 MIC12YBR262C 321 nt9.29□□□□□ -0.92
YDL180WQ12301 TIM17YJL143W 477 nt9.27□□□□□ -0.93
YDL180WQ12301 GLK1YCL040W 1503 nt9.22□□□□□ -0.93
YDL180WQ12301 YGR201CYGR201C 678 nt9.22□□□□□ -0.93
YDL180WQ12301 NAT4YMR069W 858 nt9.22□□□□□ -0.93
YDL180WQ12301 XDJ1YLR090W 1380 nt9.22□□□□□ -0.93
YDL180WQ12301 SHM2YLR058C 1410 nt9.2□□□□□ -0.94
YDL180WQ12301 MIR1YJR077C 936 nt9.19□□□□□ -0.94
YDL180WQ12301 HHO1YPL127C 777 nt9.19□□□□□ -0.94
YDL180WQ12301 PAU7YAR020C 168 nt9.17□□□□□ -0.94
YDL180WQ12301 GDH3YAL062W 1374 nt9.15□□□□□ -0.94
YDL180WQ12301 THI74YDR438W 1113 nt9.15□□□□□ -0.94
YDL180WQ12301 MSF1YPR047W 1410 nt9.14□□□□□ -0.95
YDL180WQ12301 SWE1YJL187C 2460 nt9.13□□□□□ -0.95
YDL180WQ12301 NIT1YIL164C 600 nt9.11□□□□□ -0.95
YDL180WQ12301 CCA1YER168C 1641 nt9.1□□□□□ -0.95
YDL180WQ12301 SGT2YOR007C 1041 nt9.1□□□□□ -0.95
YDL180WQ12301 AVT6YER119C 1347 nt9.08□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 BOR1YNL275W 1731 nt9.07□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 SHB17YKR043C 816 nt9.06□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 DAT1YML113W 747 nt9.06□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 GOR1YNL274C 1053 nt9.06□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 UBA4YHR111W 1323 nt9.05□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 AGP1YCL025C 1902 nt9.04□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 SBA1YKL117W 651 nt9.03□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 UME6YDR207C 2511 nt9.02□□□□□ -0.96
YDL180WQ12301 YDR010CYDR010C 333 nt9□□□□□ -0.97
YDL180WQ12301 YSR3YKR053C 1215 nt8.99□□□□□ -0.97
YDL180WQ12301 YCR102CYCR102C 1107 nt8.98□□□□□ -0.97
YDL180WQ12301 YGL034CYGL034C 366 nt8.98□□□□□ -0.97
YDL180WQ12301 RET2YFR051C 1641 nt8.98□□□□□ -0.97
YDL180WQ12301 YCR087WYCR087W 516 nt8.96□□□□□ -0.98
YDL180WQ12301 DUS1YML080W 1272 nt8.95□□□□□ -0.98
YDL180WQ12301 DUT1YBR252W 444 nt8.95□□□□□ -0.98
YDL180WQ12301 HSP60YLR259C 1719 nt8.94□□□□□ -0.98
YDL180WQ12301 PHO89YBR296C 1725 nt8.93□□□□□ -0.98
YDL180WQ12301 YCL074WYCL074W 927 nt8.9□□□□□ -0.98
YDL180WQ12301 XYL2YLR070C 1071 nt8.9□□□□□ -0.98
YDL180WQ12301 AIM45YPR004C 1035 nt8.87□□□□□ -0.99
YDL180WQ12301 STR3YGL184C 1398 nt8.86□□□□□ -0.99
YDL180WQ12301 NBP35YGL091C 987 nt8.86□□□□□ -0.99
YDL180WQ12301 MRP20YDR405W 792 nt8.85□□□□□ -0.99
YDL180WQ12301 NDI1YML120C 1542 nt8.85□□□□□ -0.99
YDL180WQ12301 TIR3YIL011W 810 nt8.84□□□□□ -0.99
YDL180WQ12301 RBG1YAL036C 1110 nt8.84□□□□□ -0.99
YDL180WQ12301 GLR1YPL091W 1452 nt8.83□□□□□ -1
YDL180WQ12301 SFA1YDL168W 1161 nt8.83□□□□□ -1
YDL180WQ12301 AQY2YLL052C 450 nt8.83□□□□□ -1
YDL180WQ12301 FUR4YBR021W 1902 nt8.83□□□□□ -1
YDL180WQ12301 COQ2YNR041C 1119 nt8.82□□□□□ -1
YDL180WQ12301 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.81□□□□□ -1
YDL180WQ12301 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.81□□□□□ -1
YDL180WQ12301 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.81□□□□□ -1
YDL180WQ12301 YMR244WYMR244W 1068 nt8.8□□□□□ -1
YDL180WQ12301 LSC2YGR244C 1284 nt8.78□□□□□ -1
YDL180WQ12301 MCH5YOR306C 1566 nt8.77□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 RPL4BYDR012W 1089 nt8.76□□□□□ -1.01
YDL180WQ12301 SHH4YLR164W 507 nt8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms