Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 ERF2YLR246W 1080 nt11.25□□□□□ -0.61
PUF2Q12221 LYS4YDR234W 2082 nt11.24□□□□□ -0.61
PUF2Q12221 STB1YNL309W 1263 nt11.22□□□□□ -0.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 DDR2YOL052C-A 186 nt11.2□□□□□ -0.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPC25YER018C 666 nt11.19□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 YFL067WYFL067W 528 nt11.19□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 PRE6YOL038W 765 nt11.19□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.18□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 YFR018CYFR018C 1092 nt11.17□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 BDH1YAL060W 1149 nt11.16□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 MIC10YCL057C-A 294 nt11.16□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 PTK1YKL198C 1989 nt11.16□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 CCT4YDL143W 1587 nt11.16□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.15□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 SNG1YGR197C 1644 nt11.15□□□□□ -0.62
PUF2Q12221 VPS60YDR486C 690 nt11.13□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.13□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 GPI16YHR188C 1833 nt11.12□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 HEM12YDR047W 1089 nt11.12□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 PAU16YKL224C 372 nt11.12□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 ANP1YEL036C 1503 nt11.11□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 YFL066CYFL066C 1179 nt11.11□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 ALG3YBL082C 1377 nt11.11□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 YSP3YOR003W 1437 nt11.1□□□□□ -0.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 FEN2YCR028C 1539 nt11.09□□□□□ -0.63
PUF2Q12221 SWC5YBR231C 912 nt11.08□□□□□ -0.64
PUF2Q12221 PEX25YPL112C 1185 nt11.07□□□□□ -0.64
PUF2Q12221 YLR415CYLR415C 339 nt11.06□□□□□ -0.64
PUF2Q12221 YNL115CYNL115C 1935 nt11.05□□□□□ -0.64 RIP-Chip
PUF2Q12221 RRT5YFR032C 870 nt11.03□□□□□ -0.64
PUF2Q12221 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.99□□□□□ -0.65
PUF2Q12221 YIR016WYIR016W 798 nt10.99□□□□□ -0.65
PUF2Q12221 NVJ2YPR091C 2313 nt10.98□□□□□ -0.65
PUF2Q12221 YFL054CYFL054C 1941 nt10.96□□□□□ -0.66
PUF2Q12221 PAC11YDR488C 1602 nt10.95□□□□□ -0.66
PUF2Q12221 SPT8YLR055C 1809 nt10.92□□□□□ -0.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 MIC12YBR262C 321 nt10.87□□□□□ -0.67
PUF2Q12221 RAX1YOR301W 1308 nt10.86□□□□□ -0.67
PUF2Q12221 BNA2YJR078W 1362 nt10.86□□□□□ -0.67
PUF2Q12221 VPS75YNL246W 795 nt10.85□□□□□ -0.67
PUF2Q12221 XDJ1YLR090W 1380 nt10.82□□□□□ -0.68
PUF2Q12221 SHM2YLR058C 1410 nt10.82□□□□□ -0.68
PUF2Q12221 TIM17YJL143W 477 nt10.8□□□□□ -0.68
PUF2Q12221 MIR1YJR077C 936 nt10.8□□□□□ -0.68
PUF2Q12221 NAT4YMR069W 858 nt10.78□□□□□ -0.68
PUF2Q12221 SBA1YKL117W 651 nt10.76□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 GLK1YCL040W 1503 nt10.75□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 HHO1YPL127C 777 nt10.75□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 SWE1YJL187C 2460 nt10.74□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 THI74YDR438W 1113 nt10.73□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 NIT1YIL164C 600 nt10.73□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 GDH3YAL062W 1374 nt10.73□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 CCA1YER168C 1641 nt10.73□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 AGP1YCL025C 1902 nt10.72□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 YGR201CYGR201C 678 nt10.71□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 SGT2YOR007C 1041 nt10.71□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 MSF1YPR047W 1410 nt10.71□□□□□ -0.69
PUF2Q12221 PAU7YAR020C 168 nt10.68□□□□□ -0.7
PUF2Q12221 DUT1YBR252W 444 nt10.67□□□□□ -0.7 RIP-Chip
PUF2Q12221 SHB17YKR043C 816 nt10.65□□□□□ -0.7
PUF2Q12221 DAT1YML113W 747 nt10.65□□□□□ -0.7 RIP-Chip
PUF2Q12221 AVT6YER119C 1347 nt10.64□□□□□ -0.71
PUF2Q12221 YDR010CYDR010C 333 nt10.62□□□□□ -0.71
PUF2Q12221 UBA4YHR111W 1323 nt10.61□□□□□ -0.71
PUF2Q12221 GOR1YNL274C 1053 nt10.56□□□□□ -0.72
PUF2Q12221 YGL034CYGL034C 366 nt10.54□□□□□ -0.72
PUF2Q12221 YSR3YKR053C 1215 nt10.54□□□□□ -0.72
PUF2Q12221 XYL2YLR070C 1071 nt10.5□□□□□ -0.73
PUF2Q12221 RET2YFR051C 1641 nt10.5□□□□□ -0.73
PUF2Q12221 PHO89YBR296C 1725 nt10.48□□□□□ -0.73
PUF2Q12221 DUS1YML080W 1272 nt10.48□□□□□ -0.73
PUF2Q12221 YCR102CYCR102C 1107 nt10.47□□□□□ -0.73
PUF2Q12221 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.43□□□□□ -0.74
PUF2Q12221 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.43□□□□□ -0.74
PUF2Q12221 STR3YGL184C 1398 nt10.42□□□□□ -0.74
PUF2Q12221 SFA1YDL168W 1161 nt10.42□□□□□ -0.74
PUF2Q12221 YJL225CYJL225C 5277 nt10.42□□□□□ -0.74
PUF2Q12221 RBG1YAL036C 1110 nt10.41□□□□□ -0.74 RIP-Chip
PUF2Q12221 NBP35YGL091C 987 nt10.4□□□□□ -0.74
PUF2Q12221 SHH4YLR164W 507 nt10.4□□□□□ -0.74
PUF2Q12221 AQY2YLL052C 450 nt10.39□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 YCL074WYCL074W 927 nt10.38□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 COQ2YNR041C 1119 nt10.38□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 FUR4YBR021W 1902 nt10.38□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 NDI1YML120C 1542 nt10.38□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 YCR087WYCR087W 516 nt10.37□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.37□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 YMR244WYMR244W 1068 nt10.37□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 AIM45YPR004C 1035 nt10.36□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 GLR1YPL091W 1452 nt10.34□□□□□ -0.75
PUF2Q12221 MRP20YDR405W 792 nt10.32□□□□□ -0.76
PUF2Q12221 TIR3YIL011W 810 nt10.3□□□□□ -0.76
PUF2Q12221 TOM6YOR045W 186 nt10.26□□□□□ -0.77
PUF2Q12221 POM34YLR018C 900 nt10.24□□□□□ -0.77 RIP-Chip
PUF2Q12221 PRO1YDR300C 1287 nt10.23□□□□□ -0.77
PUF2Q12221 PEX2YJL210W 816 nt10.21□□□□□ -0.77
PUF2Q12221 RPL4BYDR012W 1089 nt10.19□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 RPL4AYBR031W 1089 nt10.19□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 HSP60YLR259C 1719 nt10.19□□□□□ -0.78
PUF2Q12221 ARP6YLR085C 1317 nt10.18□□□□□ -0.78
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