Protein–RNA interactions for Protein: Q12110

YLR049C, Uncharacterized protein YLR049C, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR049CQ12110 YJL225CYJL225C 5277 nt10.69□□□□□ -0.7
YLR049CQ12110 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR049CQ12110 RTG1YOL067C 534 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR049CQ12110 ANP1YEL036C 1503 nt10.65□□□□□ -0.7
YLR049CQ12110 STB1YNL309W 1263 nt10.65□□□□□ -0.7
YLR049CQ12110 ADO1YJR105W 1023 nt10.64□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 WSC2YNL283C 1512 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 SPC25YER018C 666 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 AHT1YHR093W 549 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 RAX1YOR301W 1308 nt10.61□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 YEL076CYEL076C 651 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 YLR464WYLR464W 651 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 YPR064WYPR064W 420 nt10.59□□□□□ -0.71
YLR049CQ12110 GPI16YHR188C 1833 nt10.58□□□□□ -0.72
YLR049CQ12110 FEN2YCR028C 1539 nt10.58□□□□□ -0.72
YLR049CQ12110 NVJ2YPR091C 2313 nt10.57□□□□□ -0.72
YLR049CQ12110 VPS60YDR486C 690 nt10.55□□□□□ -0.72
YLR049CQ12110 UBX6YJL048C 1191 nt10.55□□□□□ -0.72
YLR049CQ12110 CCT4YDL143W 1587 nt10.55□□□□□ -0.72
YLR049CQ12110 CCA1YER168C 1641 nt10.53□□□□□ -0.72
YLR049CQ12110 TAD3YLR316C 969 nt10.52□□□□□ -0.73
YLR049CQ12110 BNA2YJR078W 1362 nt10.52□□□□□ -0.73
YLR049CQ12110 MIC12YBR262C 321 nt10.5□□□□□ -0.73
YLR049CQ12110 ALG3YBL082C 1377 nt10.5□□□□□ -0.73
YLR049CQ12110 YIR016WYIR016W 798 nt10.49□□□□□ -0.73
YLR049CQ12110 HUA1YGR268C 597 nt10.48□□□□□ -0.73
YLR049CQ12110 SWC5YBR231C 912 nt10.47□□□□□ -0.73
YLR049CQ12110 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.43□□□□□ -0.74
YLR049CQ12110 BDH1YAL060W 1149 nt10.4□□□□□ -0.74
YLR049CQ12110 BOR1YNL275W 1731 nt10.4□□□□□ -0.74
YLR049CQ12110 AGP1YCL025C 1902 nt10.4□□□□□ -0.74
YLR049CQ12110 HHO1YPL127C 777 nt10.39□□□□□ -0.75
YLR049CQ12110 FUR4YBR021W 1902 nt10.37□□□□□ -0.75
YLR049CQ12110 HSP60YLR259C 1719 nt10.37□□□□□ -0.75
YLR049CQ12110 YLR415CYLR415C 339 nt10.34□□□□□ -0.75
YLR049CQ12110 YGR201CYGR201C 678 nt10.33□□□□□ -0.76
YLR049CQ12110 GLK1YCL040W 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
YLR049CQ12110 XDJ1YLR090W 1380 nt10.3□□□□□ -0.76
YLR049CQ12110 YDR094WYDR094W 336 nt10.3□□□□□ -0.76
YLR049CQ12110 YSP3YOR003W 1437 nt10.3□□□□□ -0.76
YLR049CQ12110 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.27□□□□□ -0.76
YLR049CQ12110 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.27□□□□□ -0.76
YLR049CQ12110 DUS1YML080W 1272 nt10.26□□□□□ -0.77
YLR049CQ12110 DUT1YBR252W 444 nt10.24□□□□□ -0.77
YLR049CQ12110 GDH3YAL062W 1374 nt10.24□□□□□ -0.77
YLR049CQ12110 YCL074WYCL074W 927 nt10.23□□□□□ -0.77
YLR049CQ12110 SHM2YLR058C 1410 nt10.23□□□□□ -0.77
YLR049CQ12110 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.21□□□□□ -0.77
YLR049CQ12110 AVT6YER119C 1347 nt10.21□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 YNL115CYNL115C 1935 nt10.2□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 PEX25YPL112C 1185 nt10.2□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 TIM17YJL143W 477 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 PRP4YPR178W 1398 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 GOR1YNL274C 1053 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.17□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.17□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 YFL066CYFL066C 1179 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 STR3YGL184C 1398 nt10.15□□□□□ -0.78
YLR049CQ12110 YKR005CYKR005C 1578 nt10.14□□□□□ -0.79
YLR049CQ12110 YFR018CYFR018C 1092 nt10.14□□□□□ -0.79
YLR049CQ12110 NIT1YIL164C 600 nt10.14□□□□□ -0.79
YLR049CQ12110 DPS1YLL018C 1674 nt10.12□□□□□ -0.79
YLR049CQ12110 DAT1YML113W 747 nt10.08□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 VPS75YNL246W 795 nt10.08□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 PRE6YOL038W 765 nt10.08□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 SGT2YOR007C 1041 nt10.08□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 YGR259CYGR259C 441 nt10.07□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 AQY2YLL052C 450 nt10.07□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 BMT6YLR063W 1098 nt10.06□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 AAC1YMR056C 930 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 ALG12YNR030W 1656 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR049CQ12110 YCR102CYCR102C 1107 nt10□□□□□ -0.81
YLR049CQ12110 SNF1YDR477W 1902 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR049CQ12110 RTN2YDL204W 1182 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR049CQ12110 RRT5YFR032C 870 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR049CQ12110 NBP35YGL091C 987 nt9.97□□□□□ -0.81
YLR049CQ12110 IRC24YIR036C 792 nt9.94□□□□□ -0.82
YLR049CQ12110 PAU16YKL224C 372 nt9.92□□□□□ -0.82
YLR049CQ12110 PAU7YAR020C 168 nt9.92□□□□□ -0.82
YLR049CQ12110 SBA1YKL117W 651 nt9.91□□□□□ -0.82
YLR049CQ12110 BIO5YNR056C 1686 nt9.9□□□□□ -0.82
YLR049CQ12110 MIR1YJR077C 936 nt9.87□□□□□ -0.83
YLR049CQ12110 UME6YDR207C 2511 nt9.87□□□□□ -0.83
YLR049CQ12110 ARP6YLR085C 1317 nt9.86□□□□□ -0.83
YLR049CQ12110 YDR010CYDR010C 333 nt9.86□□□□□ -0.83
YLR049CQ12110 SHB17YKR043C 816 nt9.86□□□□□ -0.83
YLR049CQ12110 PLB1YMR008C 1995 nt9.86□□□□□ -0.83
YLR049CQ12110 TIR3YIL011W 810 nt9.83□□□□□ -0.84
YLR049CQ12110 SHH4YLR164W 507 nt9.82□□□□□ -0.84
YLR049CQ12110 MCH5YOR306C 1566 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR049CQ12110 LSC2YGR244C 1284 nt9.78□□□□□ -0.84
YLR049CQ12110 UBA4YHR111W 1323 nt9.78□□□□□ -0.84
YLR049CQ12110 RET2YFR051C 1641 nt9.78□□□□□ -0.84
YLR049CQ12110 THI74YDR438W 1113 nt9.77□□□□□ -0.85
YLR049CQ12110 PBP1YGR178C 2169 nt9.76□□□□□ -0.85
YLR049CQ12110 SFA1YDL168W 1161 nt9.76□□□□□ -0.85
YLR049CQ12110 NAR1YNL240C 1476 nt9.76□□□□□ -0.85
YLR049CQ12110 PRO1YDR300C 1287 nt9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms