Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 PEX25YPL112C 1185 nt11.82□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 YFL067WYFL067W 528 nt11.81□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 SPC25YER018C 666 nt11.8□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 YLR415CYLR415C 339 nt11.8□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.79□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 GPI16YHR188C 1833 nt11.79□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 CCT4YDL143W 1587 nt11.78□□□□□ -0.52
HFI1Q12060 YFL066CYFL066C 1179 nt11.77□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 BDH1YAL060W 1149 nt11.77□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 ATF2YGR177C 1608 nt11.75□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 SWC5YBR231C 912 nt11.75□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 YSP3YOR003W 1437 nt11.75□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 PCH2YBR186W 1695 nt11.74□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 YNL115CYNL115C 1935 nt11.72□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.72□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 CRR1YLR213C 1269 nt11.72□□□□□ -0.53
HFI1Q12060 NAT4YMR069W 858 nt11.7□□□□□ -0.54
HFI1Q12060 VPS60YDR486C 690 nt11.69□□□□□ -0.54
HFI1Q12060 GLK1YCL040W 1503 nt11.68□□□□□ -0.54
HFI1Q12060 FEN2YCR028C 1539 nt11.65□□□□□ -0.54
HFI1Q12060 SBA1YKL117W 651 nt11.65□□□□□ -0.54
HFI1Q12060 HEM12YDR047W 1089 nt11.63□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 ANP1YEL036C 1503 nt11.63□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 GUT2YIL155C 1950 nt11.63□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 BOP3YNL042W 1191 nt11.62□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 VPS75YNL246W 795 nt11.61□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 SNG1YGR197C 1644 nt11.6□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 ALG3YBL082C 1377 nt11.6□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 NCP1YHR042W 2076 nt11.59□□□□□ -0.55
HFI1Q12060 SPT8YLR055C 1809 nt11.56□□□□□ -0.56
HFI1Q12060 MSF1YPR047W 1410 nt11.55□□□□□ -0.56
HFI1Q12060 RTF1YGL244W 1677 nt11.55□□□□□ -0.56
HFI1Q12060 THI74YDR438W 1113 nt11.54□□□□□ -0.56
HFI1Q12060 MIC10YCL057C-A 294 nt11.54□□□□□ -0.56
HFI1Q12060 YIR016WYIR016W 798 nt11.53□□□□□ -0.56
HFI1Q12060 LYS4YDR234W 2082 nt11.53□□□□□ -0.56
HFI1Q12060 MIR1YJR077C 936 nt11.52□□□□□ -0.57
HFI1Q12060 PAU7YAR020C 168 nt11.52□□□□□ -0.57
HFI1Q12060 TIM17YJL143W 477 nt11.51□□□□□ -0.57
HFI1Q12060 PIB2YGL023C 1908 nt11.47□□□□□ -0.57
HFI1Q12060 BNA2YJR078W 1362 nt11.47□□□□□ -0.57
HFI1Q12060 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.39□□□□□ -0.59
HFI1Q12060 DAT1YML113W 747 nt11.39□□□□□ -0.59
HFI1Q12060 SHM2YLR058C 1410 nt11.38□□□□□ -0.59
HFI1Q12060 XDJ1YLR090W 1380 nt11.38□□□□□ -0.59
HFI1Q12060 RAX1YOR301W 1308 nt11.35□□□□□ -0.59
HFI1Q12060 PAC11YDR488C 1602 nt11.35□□□□□ -0.59
HFI1Q12060 UBA4YHR111W 1323 nt11.34□□□□□ -0.59
HFI1Q12060 MIC12YBR262C 321 nt11.33□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 YGL034CYGL034C 366 nt11.32□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 SHB17YKR043C 816 nt11.32□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 GDH3YAL062W 1374 nt11.3□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 YSR3YKR053C 1215 nt11.3□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 PTK1YKL198C 1989 nt11.29□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 YGR201CYGR201C 678 nt11.29□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 HHO1YPL127C 777 nt11.29□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 SGT2YOR007C 1041 nt11.28□□□□□ -0.6
HFI1Q12060 GLR1YPL091W 1452 nt11.25□□□□□ -0.61
HFI1Q12060 NIT1YIL164C 600 nt11.24□□□□□ -0.61
HFI1Q12060 YMR244WYMR244W 1068 nt11.24□□□□□ -0.61
HFI1Q12060 YJL225CYJL225C 5277 nt11.23□□□□□ -0.61
HFI1Q12060 YCR087WYCR087W 516 nt11.22□□□□□ -0.61
HFI1Q12060 YFL054CYFL054C 1941 nt11.22□□□□□ -0.61
HFI1Q12060 YDR010CYDR010C 333 nt11.21□□□□□ -0.61
HFI1Q12060 NVJ2YPR091C 2313 nt11.21□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 NDI1YML120C 1542 nt11.2□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 XYL2YLR070C 1071 nt11.2□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 AVT6YER119C 1347 nt11.19□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 RET2YFR051C 1641 nt11.18□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 PHO89YBR296C 1725 nt11.18□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 RBG1YAL036C 1110 nt11.17□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 GOR1YNL274C 1053 nt11.16□□□□□ -0.62
HFI1Q12060 AIM45YPR004C 1035 nt11.11□□□□□ -0.63
HFI1Q12060 MRP20YDR405W 792 nt11.09□□□□□ -0.63
HFI1Q12060 YCR102CYCR102C 1107 nt11.08□□□□□ -0.64
HFI1Q12060 RBG2YGR173W 1107 nt11.07□□□□□ -0.64
HFI1Q12060 CCA1YER168C 1641 nt11.03□□□□□ -0.64
HFI1Q12060 YMR226CYMR226C 804 nt11.02□□□□□ -0.65
HFI1Q12060 COQ2YNR041C 1119 nt10.99□□□□□ -0.65
HFI1Q12060 AGP1YCL025C 1902 nt10.98□□□□□ -0.65
HFI1Q12060 DUT1YBR252W 444 nt10.96□□□□□ -0.65
HFI1Q12060 SWE1YJL187C 2460 nt10.96□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.95□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 SFA1YDL168W 1161 nt10.94□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 DUS1YML080W 1272 nt10.94□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 RPL4BYDR012W 1089 nt10.93□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 YLR111WYLR111W 333 nt10.93□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 RPL4AYBR031W 1089 nt10.93□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 CLB6YGR109C 1143 nt10.92□□□□□ -0.66
HFI1Q12060 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.9□□□□□ -0.67
HFI1Q12060 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.9□□□□□ -0.67
HFI1Q12060 TIR3YIL011W 810 nt10.89□□□□□ -0.67
HFI1Q12060 NBP35YGL091C 987 nt10.87□□□□□ -0.67
HFI1Q12060 SDH5YOL071W 489 nt10.87□□□□□ -0.67
HFI1Q12060 UTH1YKR042W 1098 nt10.84□□□□□ -0.67
HFI1Q12060 AQY2YLL052C 450 nt10.83□□□□□ -0.68
HFI1Q12060 RPS14BYJL191W 417 nt10.81□□□□□ -0.68
HFI1Q12060 SHH4YLR164W 507 nt10.8□□□□□ -0.68
HFI1Q12060 YCL074WYCL074W 927 nt10.79□□□□□ -0.68
HFI1Q12060 YML089CYML089C 369 nt10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.5 ms