Protein–RNA interactions for Protein: Q12040

YOR283W, Broad-specificity phosphatase YOR283W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR283WQ12040 TRM5YHR070W 1500 nt9.7□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 GAL1YBR020W 1587 nt9.69□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 YKR040CYKR040C 504 nt9.68□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 DDR2YOL052C-A 186 nt9.68□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 LPX1YOR084W 1164 nt9.67□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.66□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 BMT6YLR063W 1098 nt9.65□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 DIC1YLR348C 897 nt9.65□□□□□ -0.86
YOR283WQ12040 YKR005CYKR005C 1578 nt9.63□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 BNA2YJR078W 1362 nt9.63□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 ANP1YEL036C 1503 nt9.61□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.61□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.61□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.61□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.61□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.61□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 WSC2YNL283C 1512 nt9.61□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 BIO5YNR056C 1686 nt9.59□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 SNF1YDR477W 1902 nt9.59□□□□□ -0.87
YOR283WQ12040 MIC12YBR262C 321 nt9.58□□□□□ -0.88
YOR283WQ12040 AGP1YCL025C 1902 nt9.58□□□□□ -0.88
YOR283WQ12040 DUS1YML080W 1272 nt9.57□□□□□ -0.88
YOR283WQ12040 YCL074WYCL074W 927 nt9.56□□□□□ -0.88
YOR283WQ12040 AQY1YPR192W 918 nt9.56□□□□□ -0.88
YOR283WQ12040 YGR259CYGR259C 441 nt9.54□□□□□ -0.88
YOR283WQ12040 PBP1YGR178C 2169 nt9.52□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.51□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 STB1YNL309W 1263 nt9.51□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 FEN2YCR028C 1539 nt9.51□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 SPC25YER018C 666 nt9.5□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 IRC24YIR036C 792 nt9.5□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 HHO1YPL127C 777 nt9.5□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 CYT2YKL087C 675 nt9.48□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 CMP2YML057W 1815 nt9.47□□□□□ -0.89
YOR283WQ12040 GPI16YHR188C 1833 nt9.46□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 HSL7YBR133C 2484 nt9.45□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 YIR016WYIR016W 798 nt9.43□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 TIM23YNR017W 669 nt9.42□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 PTH1YHR189W 573 nt9.41□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 YLR179CYLR179C 606 nt9.41□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.4□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.4□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 XDJ1YLR090W 1380 nt9.4□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 VPS60YDR486C 690 nt9.4□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 YGR201CYGR201C 678 nt9.4□□□□□ -0.9
YOR283WQ12040 YLR235CYLR235C 399 nt9.38□□□□□ -0.91
YOR283WQ12040 STR3YGL184C 1398 nt9.37□□□□□ -0.91
YOR283WQ12040 CCT4YDL143W 1587 nt9.37□□□□□ -0.91
YOR283WQ12040 ALG3YBL082C 1377 nt9.35□□□□□ -0.91
YOR283WQ12040 AHT1YHR093W 549 nt9.33□□□□□ -0.92
YOR283WQ12040 DUT1YBR252W 444 nt9.33□□□□□ -0.92
YOR283WQ12040 SWC5YBR231C 912 nt9.32□□□□□ -0.92
YOR283WQ12040 AQY2YLL052C 450 nt9.28□□□□□ -0.92
YOR283WQ12040 GOR1YNL274C 1053 nt9.26□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 SPP1YPL138C 1062 nt9.26□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.26□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.26□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 AVT6YER119C 1347 nt9.26□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 YAT1YAR035W 2064 nt9.25□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 RTN2YDL204W 1182 nt9.25□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 YPR064WYPR064W 420 nt9.23□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 GDH3YAL062W 1374 nt9.22□□□□□ -0.93
YOR283WQ12040 YKL030WYKL030W 606 nt9.21□□□□□ -0.94
YOR283WQ12040 HEL2YDR266C 1920 nt9.21□□□□□ -0.94
YOR283WQ12040 NDI1YML120C 1542 nt9.21□□□□□ -0.94
YOR283WQ12040 TAD3YLR316C 969 nt9.16□□□□□ -0.94
YOR283WQ12040 RPM1RPM1 483 nt9.15□□□□□ -0.94
YOR283WQ12040 SHM2YLR058C 1410 nt9.1□□□□□ -0.95
YOR283WQ12040 PLB1YMR008C 1995 nt9.08□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 SPT20YOL148C 1815 nt9.08□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 BDH1YAL060W 1149 nt9.07□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 HIF1YLL022C 1158 nt9.06□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 YLR415CYLR415C 339 nt9.05□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 DAT1YML113W 747 nt9.05□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 MOT3YMR070W 1473 nt9.04□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 INA1YLR413W 2028 nt9.04□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 RPC82YPR190C 1965 nt9.03□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 TIM17YJL143W 477 nt9.03□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 ALD4YOR374W 1560 nt9.03□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 ARP6YLR085C 1317 nt9.03□□□□□ -0.96
YOR283WQ12040 NBP35YGL091C 987 nt9.02□□□□□ -0.97
YOR283WQ12040 PRM5YIL117C 957 nt9.02□□□□□ -0.97
YOR283WQ12040 YCR102CYCR102C 1107 nt8.99□□□□□ -0.97
YOR283WQ12040 NIT1YIL164C 600 nt8.99□□□□□ -0.97
YOR283WQ12040 RIM8YGL045W 1629 nt8.98□□□□□ -0.97
YOR283WQ12040 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.93□□□□□ -0.98
YOR283WQ12040 SGT2YOR007C 1041 nt8.93□□□□□ -0.98
YOR283WQ12040 UTR1YJR049C 1593 nt8.92□□□□□ -0.98
YOR283WQ12040 YSP3YOR003W 1437 nt8.92□□□□□ -0.98
YOR283WQ12040 YGL114WYGL114W 2178 nt8.9□□□□□ -0.98
YOR283WQ12040 ZRT3YKL175W 1512 nt8.88□□□□□ -0.99
YOR283WQ12040 MAE1YKL029C 2010 nt8.88□□□□□ -0.99
YOR283WQ12040 RTG1YOL067C 534 nt8.86□□□□□ -0.99
YOR283WQ12040 GAP1YKR039W 1809 nt8.85□□□□□ -0.99
YOR283WQ12040 MET2YNL277W 1461 nt8.85□□□□□ -0.99
YOR283WQ12040 SAM35YHR083W 990 nt8.85□□□□□ -0.99
YOR283WQ12040 LSC2YGR244C 1284 nt8.83□□□□□ -1
YOR283WQ12040 MUP1YGR055W 1725 nt8.81□□□□□ -1
YOR283WQ12040 TIR3YIL011W 810 nt8.81□□□□□ -1
YOR283WQ12040 YNL115CYNL115C 1935 nt8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms