Protein–RNA interactions for Protein: Q12015

YOR223W, Transmembrane protein YOR223W, yeastyeast

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR223WQ12015 LPX1YOR084W 1164 nt11.35□□□□□ -0.59
YOR223WQ12015 DPS1YLL018C 1674 nt11.34□□□□□ -0.59
YOR223WQ12015 TRM5YHR070W 1500 nt11.34□□□□□ -0.59
YOR223WQ12015 GAL1YBR020W 1587 nt11.33□□□□□ -0.6
YOR223WQ12015 YFL067WYFL067W 528 nt11.32□□□□□ -0.6
YOR223WQ12015 ERV46YAL042W 1248 nt11.31□□□□□ -0.6
YOR223WQ12015 AAC1YMR056C 930 nt11.3□□□□□ -0.6
YOR223WQ12015 YKR040CYKR040C 504 nt11.28□□□□□ -0.6
YOR223WQ12015 NAR1YNL240C 1476 nt11.27□□□□□ -0.6
YOR223WQ12015 DIC1YLR348C 897 nt11.26□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 DDR2YOL052C-A 186 nt11.26□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 SNF1YDR477W 1902 nt11.26□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 AGP1YCL025C 1902 nt11.26□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 BIO5YNR056C 1686 nt11.25□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 YKR005CYKR005C 1578 nt11.24□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.23□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 ANP1YEL036C 1503 nt11.21□□□□□ -0.61
YOR223WQ12015 MIC12YBR262C 321 nt11.17□□□□□ -0.62
YOR223WQ12015 WSC2YNL283C 1512 nt11.16□□□□□ -0.62
YOR223WQ12015 BNA2YJR078W 1362 nt11.16□□□□□ -0.62
YOR223WQ12015 BMT6YLR063W 1098 nt11.15□□□□□ -0.62
YOR223WQ12015 PBP1YGR178C 2169 nt11.15□□□□□ -0.62
YOR223WQ12015 DUS1YML080W 1272 nt11.12□□□□□ -0.63
YOR223WQ12015 YCL074WYCL074W 927 nt11.11□□□□□ -0.63
YOR223WQ12015 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.1□□□□□ -0.63
YOR223WQ12015 YGR259CYGR259C 441 nt11.09□□□□□ -0.63
YOR223WQ12015 FEN2YCR028C 1539 nt11.09□□□□□ -0.63
YOR223WQ12015 STB1YNL309W 1263 nt11.08□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 SPC25YER018C 666 nt11.06□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 PTH1YHR189W 573 nt11.06□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 AQY1YPR192W 918 nt11.05□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 HHO1YPL127C 777 nt11.04□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.04□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.04□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 CYT2YKL087C 675 nt11.03□□□□□ -0.64
YOR223WQ12015 XDJ1YLR090W 1380 nt11.02□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 YIR016WYIR016W 798 nt11.01□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 DUT1YBR252W 444 nt11.01□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 VPS60YDR486C 690 nt11□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 IRC24YIR036C 792 nt11□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 SPP1YPL138C 1062 nt10.99□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 TIM23YNR017W 669 nt10.98□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 GPI16YHR188C 1833 nt10.98□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 YLR179CYLR179C 606 nt10.97□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 ALG3YBL082C 1377 nt10.97□□□□□ -0.65
YOR223WQ12015 YJL225CYJL225C 5277 nt10.95□□□□□ -0.66
YOR223WQ12015 STR3YGL184C 1398 nt10.95□□□□□ -0.66
YOR223WQ12015 CCT4YDL143W 1587 nt10.93□□□□□ -0.66
YOR223WQ12015 YGR201CYGR201C 678 nt10.89□□□□□ -0.67
YOR223WQ12015 YLR235CYLR235C 399 nt10.89□□□□□ -0.67
YOR223WQ12015 YAT1YAR035W 2064 nt10.89□□□□□ -0.67
YOR223WQ12015 AHT1YHR093W 549 nt10.88□□□□□ -0.67
YOR223WQ12015 SWC5YBR231C 912 nt10.84□□□□□ -0.67
YOR223WQ12015 AQY2YLL052C 450 nt10.83□□□□□ -0.68
YOR223WQ12015 CMP2YML057W 1815 nt10.83□□□□□ -0.68
YOR223WQ12015 AVT6YER119C 1347 nt10.78□□□□□ -0.68
YOR223WQ12015 HSL7YBR133C 2484 nt10.78□□□□□ -0.68
YOR223WQ12015 GOR1YNL274C 1053 nt10.74□□□□□ -0.69
YOR223WQ12015 GDH3YAL062W 1374 nt10.74□□□□□ -0.69
YOR223WQ12015 YKL030WYKL030W 606 nt10.73□□□□□ -0.69
YOR223WQ12015 RTN2YDL204W 1182 nt10.72□□□□□ -0.69
YOR223WQ12015 YPR064WYPR064W 420 nt10.72□□□□□ -0.69
YOR223WQ12015 TAD3YLR316C 969 nt10.66□□□□□ -0.7
YOR223WQ12015 RTG1YOL067C 534 nt10.66□□□□□ -0.7
YOR223WQ12015 NDI1YML120C 1542 nt10.64□□□□□ -0.71
YOR223WQ12015 CSM2YIL132C 642 nt10.64□□□□□ -0.71
YOR223WQ12015 BDH1YAL060W 1149 nt10.63□□□□□ -0.71
YOR223WQ12015 SHM2YLR058C 1410 nt10.63□□□□□ -0.71
YOR223WQ12015 PLB1YMR008C 1995 nt10.61□□□□□ -0.71
YOR223WQ12015 HIF1YLL022C 1158 nt10.59□□□□□ -0.71
YOR223WQ12015 RPC82YPR190C 1965 nt10.59□□□□□ -0.71
YOR223WQ12015 PRM5YIL117C 957 nt10.57□□□□□ -0.72
YOR223WQ12015 SPT20YOL148C 1815 nt10.56□□□□□ -0.72
YOR223WQ12015 NIT1YIL164C 600 nt10.54□□□□□ -0.72
YOR223WQ12015 NBP35YGL091C 987 nt10.53□□□□□ -0.72
YOR223WQ12015 YLR415CYLR415C 339 nt10.52□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 DAT1YML113W 747 nt10.52□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.5□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.5□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 ARP6YLR085C 1317 nt10.5□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 ALD4YOR374W 1560 nt10.48□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 INA1YLR413W 2028 nt10.47□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 TIM17YJL143W 477 nt10.47□□□□□ -0.73
YOR223WQ12015 YSP3YOR003W 1437 nt10.45□□□□□ -0.74
YOR223WQ12015 MRPL8YJL063C 717 nt10.45□□□□□ -0.74
YOR223WQ12015 SGT2YOR007C 1041 nt10.44□□□□□ -0.74
YOR223WQ12015 UTR1YJR049C 1593 nt10.43□□□□□ -0.74
YOR223WQ12015 YCR102CYCR102C 1107 nt10.42□□□□□ -0.74
YOR223WQ12015 HUA1YGR268C 597 nt10.4□□□□□ -0.74
YOR223WQ12015 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.38□□□□□ -0.75
YOR223WQ12015 ADO1YJR105W 1023 nt10.37□□□□□ -0.75
YOR223WQ12015 HEL2YDR266C 1920 nt10.35□□□□□ -0.75
YOR223WQ12015 PAU21YOR394W 495 nt10.33□□□□□ -0.76
YOR223WQ12015 PAU22YPL282C 495 nt10.33□□□□□ -0.76
YOR223WQ12015 MUP1YGR055W 1725 nt10.33□□□□□ -0.76
YOR223WQ12015 RIM8YGL045W 1629 nt10.33□□□□□ -0.76
YOR223WQ12015 SHH4YLR164W 507 nt10.32□□□□□ -0.76
YOR223WQ12015 GAP1YKR039W 1809 nt10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.4 ms