Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 YDR094WYDR094W 336 nt11.71□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.71□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 ATF2YGR177C 1608 nt11.71□□□□□ -0.54
ABP140Q08641 YFL054CYFL054C 1941 nt11.7□□□□□ -0.54
ABP140Q08641 TAD3YLR316C 969 nt11.7□□□□□ -0.54
ABP140Q08641 LYS4YDR234W 2082 nt11.69□□□□□ -0.54
ABP140Q08641 CRR1YLR213C 1269 nt11.68□□□□□ -0.54
ABP140Q08641 YFL067WYFL067W 528 nt11.66□□□□□ -0.54
ABP140Q08641 STB1YNL309W 1263 nt11.64□□□□□ -0.55
ABP140Q08641 DDR2YOL052C-A 186 nt11.64□□□□□ -0.55
ABP140Q08641 SPC25YER018C 666 nt11.62□□□□□ -0.55
ABP140Q08641 YJL225CYJL225C 5277 nt11.61□□□□□ -0.55
ABP140Q08641 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.6□□□□□ -0.55
ABP140Q08641 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.58□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 SPT8YLR055C 1809 nt11.58□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 CCT4YDL143W 1587 nt11.57□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 SNG1YGR197C 1644 nt11.57□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 HEM12YDR047W 1089 nt11.56□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 MIC10YCL057C-A 294 nt11.56□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 GPI16YHR188C 1833 nt11.56□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 MCH5YOR306C 1566 nt11.55□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 YFR018CYFR018C 1092 nt11.55□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 ANP1YEL036C 1503 nt11.55□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 BDH1YAL060W 1149 nt11.54□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 VPS60YDR486C 690 nt11.53□□□□□ -0.56
ABP140Q08641 FEN2YCR028C 1539 nt11.51□□□□□ -0.57
ABP140Q08641 PRE6YOL038W 765 nt11.48□□□□□ -0.57
ABP140Q08641 SWC5YBR231C 912 nt11.48□□□□□ -0.57
ABP140Q08641 ALG3YBL082C 1377 nt11.48□□□□□ -0.57
ABP140Q08641 YSP3YOR003W 1437 nt11.48□□□□□ -0.57
ABP140Q08641 HSP60YLR259C 1719 nt11.47□□□□□ -0.57
ABP140Q08641 YLR415CYLR415C 339 nt11.47□□□□□ -0.57
ABP140Q08641 YFL066CYFL066C 1179 nt11.44□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.43□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 PEX25YPL112C 1185 nt11.43□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 PAU16YKL224C 372 nt11.42□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 ALG12YNR030W 1656 nt11.41□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.41□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 RRT5YFR032C 870 nt11.41□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 YIR016WYIR016W 798 nt11.41□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 YNL115CYNL115C 1935 nt11.41□□□□□ -0.58
ABP140Q08641 SWE1YJL187C 2460 nt11.33□□□□□ -0.6
ABP140Q08641 RAX1YOR301W 1308 nt11.33□□□□□ -0.6
ABP140Q08641 MIC12YBR262C 321 nt11.31□□□□□ -0.6
ABP140Q08641 BNA2YJR078W 1362 nt11.3□□□□□ -0.6
ABP140Q08641 GLK1YCL040W 1503 nt11.29□□□□□ -0.6
ABP140Q08641 VPS75YNL246W 795 nt11.25□□□□□ -0.61
ABP140Q08641 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.24□□□□□ -0.61
ABP140Q08641 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.24□□□□□ -0.61
ABP140Q08641 XDJ1YLR090W 1380 nt11.22□□□□□ -0.61
ABP140Q08641 TIM17YJL143W 477 nt11.21□□□□□ -0.61
ABP140Q08641 SHM2YLR058C 1410 nt11.2□□□□□ -0.62
ABP140Q08641 HHO1YPL127C 777 nt11.18□□□□□ -0.62
ABP140Q08641 NAR1YNL240C 1476 nt11.16□□□□□ -0.62
ABP140Q08641 YGR201CYGR201C 678 nt11.15□□□□□ -0.62
ABP140Q08641 MIR1YJR077C 936 nt11.15□□□□□ -0.62
ABP140Q08641 CCA1YER168C 1641 nt11.15□□□□□ -0.62
ABP140Q08641 GDH3YAL062W 1374 nt11.15□□□□□ -0.63
ABP140Q08641 NAT4YMR069W 858 nt11.12□□□□□ -0.63
ABP140Q08641 NIT1YIL164C 600 nt11.11□□□□□ -0.63
ABP140Q08641 AGP1YCL025C 1902 nt11.1□□□□□ -0.63
ABP140Q08641 FUR4YBR021W 1902 nt11.08□□□□□ -0.64
ABP140Q08641 THI74YDR438W 1113 nt11.08□□□□□ -0.64
ABP140Q08641 SGT2YOR007C 1041 nt11.07□□□□□ -0.64
ABP140Q08641 PAU7YAR020C 168 nt11.06□□□□□ -0.64
ABP140Q08641 MSF1YPR047W 1410 nt11.06□□□□□ -0.64
ABP140Q08641 AVT6YER119C 1347 nt11.05□□□□□ -0.64
ABP140Q08641 AAC1YMR056C 930 nt11.02□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 DUT1YBR252W 444 nt11.02□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 PRP4YPR178W 1398 nt11.02□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 SHB17YKR043C 816 nt11□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 DAT1YML113W 747 nt10.99□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 GOR1YNL274C 1053 nt10.99□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 SBA1YKL117W 651 nt10.98□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 YDR010CYDR010C 333 nt10.97□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 UBA4YHR111W 1323 nt10.97□□□□□ -0.65
ABP140Q08641 DPS1YLL018C 1674 nt10.95□□□□□ -0.66
ABP140Q08641 YCR102CYCR102C 1107 nt10.89□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 YGL034CYGL034C 366 nt10.89□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 YSR3YKR053C 1215 nt10.89□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 DUS1YML080W 1272 nt10.89□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 BIO5YNR056C 1686 nt10.89□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 RET2YFR051C 1641 nt10.87□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 BMT6YLR063W 1098 nt10.87□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 CMP2YML057W 1815 nt10.86□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 PHO89YBR296C 1725 nt10.84□□□□□ -0.67
ABP140Q08641 STR3YGL184C 1398 nt10.83□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 XYL2YLR070C 1071 nt10.83□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.82□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.82□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 YCL074WYCL074W 927 nt10.82□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 NBP35YGL091C 987 nt10.81□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 CYT2YKL087C 675 nt10.8□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 SNF1YDR477W 1902 nt10.78□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 PBP1YGR178C 2169 nt10.78□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 SFA1YDL168W 1161 nt10.78□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 AQY2YLL052C 450 nt10.78□□□□□ -0.68
ABP140Q08641 YCR087WYCR087W 516 nt10.77□□□□□ -0.69
ABP140Q08641 YKR005CYKR005C 1578 nt10.74□□□□□ -0.69
ABP140Q08641 Q0182Q0182 405 nt10.74□□□□□ -0.69
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