Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.18□□□□□ -0.94
CSI2Q08054 YFR018CYFR018C 1092 nt9.17□□□□□ -0.94
CSI2Q08054 AHT1YHR093W 549 nt9.17□□□□□ -0.94
CSI2Q08054 AQY1YPR192W 918 nt9.16□□□□□ -0.94
CSI2Q08054 WSC2YNL283C 1512 nt9.15□□□□□ -0.94
CSI2Q08054 TAD3YLR316C 969 nt9.15□□□□□ -0.94
CSI2Q08054 BIO4YNR057C 714 nt9.15□□□□□ -0.94
CSI2Q08054 YLL053CYLL053C 459 nt9.13□□□□□ -0.95
CSI2Q08054 SIM1YIL123W 1431 nt9.12□□□□□ -0.95
CSI2Q08054 FTR1YER145C 1215 nt9.11□□□□□ -0.95
CSI2Q08054 RRT5YFR032C 870 nt9.08□□□□□ -0.96
CSI2Q08054 PAU16YKL224C 372 nt9.07□□□□□ -0.96
CSI2Q08054 GAL1YBR020W 1587 nt9.07□□□□□ -0.96
CSI2Q08054 SWE1YJL187C 2460 nt9.05□□□□□ -0.96
CSI2Q08054 NAR1YNL240C 1476 nt9.03□□□□□ -0.96
CSI2Q08054 ERF2YLR246W 1080 nt9.03□□□□□ -0.96
CSI2Q08054 GLK1YCL040W 1503 nt9.02□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 HSL7YBR133C 2484 nt9.02□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 SPC25YER018C 666 nt9.02□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 TRM5YHR070W 1500 nt9.01□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 STB1YNL309W 1263 nt9.01□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 PRE6YOL038W 765 nt9.01□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 YFL067WYFL067W 528 nt9□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 BDH1YAL060W 1149 nt9□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 PEX25YPL112C 1185 nt9□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 YSP3YOR003W 1437 nt8.98□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 CRR1YLR213C 1269 nt8.98□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 GPI16YHR188C 1833 nt8.98□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 ATF2YGR177C 1608 nt8.98□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 DDR2YOL052C-A 186 nt8.97□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 CCT4YDL143W 1587 nt8.97□□□□□ -0.97
CSI2Q08054 YLR415CYLR415C 339 nt8.96□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.96□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.96□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.95□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.94□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 YFL066CYFL066C 1179 nt8.92□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 ANP1YEL036C 1503 nt8.91□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 YNL115CYNL115C 1935 nt8.91□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 VPS60YDR486C 690 nt8.9□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 SWC5YBR231C 912 nt8.9□□□□□ -0.98
CSI2Q08054 PBP1YGR178C 2169 nt8.88□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 LYS4YDR234W 2082 nt8.87□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 FEN2YCR028C 1539 nt8.87□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 HEM12YDR047W 1089 nt8.86□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 SNG1YGR197C 1644 nt8.86□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 ALG3YBL082C 1377 nt8.86□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 VPS75YNL246W 795 nt8.85□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 NAT4YMR069W 858 nt8.84□□□□□ -0.99
CSI2Q08054 AAC1YMR056C 930 nt8.83□□□□□ -1
CSI2Q08054 FUR4YBR021W 1902 nt8.82□□□□□ -1
CSI2Q08054 SBA1YKL117W 651 nt8.82□□□□□ -1
CSI2Q08054 CYT2YKL087C 675 nt8.81□□□□□ -1
CSI2Q08054 CMP2YML057W 1815 nt8.8□□□□□ -1
CSI2Q08054 MIC10YCL057C-A 294 nt8.8□□□□□ -1
CSI2Q08054 BIO5YNR056C 1686 nt8.79□□□□□ -1
CSI2Q08054 YIR016WYIR016W 798 nt8.79□□□□□ -1
CSI2Q08054 MIR1YJR077C 936 nt8.78□□□□□ -1
CSI2Q08054 PRP4YPR178W 1398 nt8.77□□□□□ -1.01
CSI2Q08054 MSF1YPR047W 1410 nt8.76□□□□□ -1.01
CSI2Q08054 THI74YDR438W 1113 nt8.74□□□□□ -1.01
CSI2Q08054 DPS1YLL018C 1674 nt8.74□□□□□ -1.01
CSI2Q08054 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI2Q08054 TIM17YJL143W 477 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI2Q08054 MIC12YBR262C 321 nt8.71□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 SNF1YDR477W 1902 nt8.7□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 BNA2YJR078W 1362 nt8.69□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 HEL2YDR266C 1920 nt8.68□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 XDJ1YLR090W 1380 nt8.66□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 RAX1YOR301W 1308 nt8.66□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 SHM2YLR058C 1410 nt8.65□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 PAU7YAR020C 168 nt8.65□□□□□ -1.02
CSI2Q08054 DAT1YML113W 747 nt8.64□□□□□ -1.03
CSI2Q08054 YGR201CYGR201C 678 nt8.63□□□□□ -1.03
CSI2Q08054 UBA4YHR111W 1323 nt8.61□□□□□ -1.03
CSI2Q08054 NIT1YIL164C 600 nt8.6□□□□□ -1.03
CSI2Q08054 SHB17YKR043C 816 nt8.6□□□□□ -1.03
CSI2Q08054 SGT2YOR007C 1041 nt8.58□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 GDH3YAL062W 1374 nt8.58□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 YGL034CYGL034C 366 nt8.57□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 HHO1YPL127C 777 nt8.57□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 YAT1YAR035W 2064 nt8.57□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 YDR010CYDR010C 333 nt8.56□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 YSR3YKR053C 1215 nt8.55□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 BMT6YLR063W 1098 nt8.55□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 NDI1YML120C 1542 nt8.54□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 YKR005CYKR005C 1578 nt8.53□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 YMR244WYMR244W 1068 nt8.53□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 RET2YFR051C 1641 nt8.53□□□□□ -1.04
CSI2Q08054 YCR087WYCR087W 516 nt8.52□□□□□ -1.05
CSI2Q08054 GLR1YPL091W 1452 nt8.51□□□□□ -1.05
CSI2Q08054 CCA1YER168C 1641 nt8.48□□□□□ -1.05
CSI2Q08054 AVT6YER119C 1347 nt8.48□□□□□ -1.05
CSI2Q08054 XYL2YLR070C 1071 nt8.47□□□□□ -1.05
CSI2Q08054 IRC24YIR036C 792 nt8.46□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 PHO89YBR296C 1725 nt8.46□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 GOR1YNL274C 1053 nt8.45□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 AIM45YPR004C 1035 nt8.45□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 YCR102CYCR102C 1107 nt8.44□□□□□ -1.06
CSI2Q08054 RBG1YAL036C 1110 nt8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms