Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 PAC11YDR488C 1602 nt8.03□□□□□ -1.12
RDS3Q06835 PTK1YKL198C 1989 nt8.02□□□□□ -1.12
RDS3Q06835 ERF2YLR246W 1080 nt8.02□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 ATF2YGR177C 1608 nt8.01□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 SPC25YER018C 666 nt8.01□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 PAU16YKL224C 372 nt8.01□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 STB1YNL309W 1263 nt8□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 PRE6YOL038W 765 nt8□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 YFL067WYFL067W 528 nt7.99□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 RRT5YFR032C 870 nt7.99□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 BDH1YAL060W 1149 nt7.99□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 CRR1YLR213C 1269 nt7.99□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 YFL054CYFL054C 1941 nt7.99□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 DDR2YOL052C-A 186 nt7.98□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 CCT4YDL143W 1587 nt7.97□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 LYS4YDR234W 2082 nt7.96□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 YSP3YOR003W 1437 nt7.96□□□□□ -1.13
RDS3Q06835 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt7.96□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 GPI16YHR188C 1833 nt7.96□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt7.95□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 PEX25YPL112C 1185 nt7.95□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 YFL066CYFL066C 1179 nt7.94□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 YLR415CYLR415C 339 nt7.94□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 ANP1YEL036C 1503 nt7.93□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 VPS60YDR486C 690 nt7.92□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 FEN2YCR028C 1539 nt7.91□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 SNG1YGR197C 1644 nt7.91□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 YNL115CYNL115C 1935 nt7.91□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 SWC5YBR231C 912 nt7.9□□□□□ -1.14
RDS3Q06835 ALG3YBL082C 1377 nt7.89□□□□□ -1.15
RDS3Q06835 HEM12YDR047W 1089 nt7.89□□□□□ -1.15
RDS3Q06835 MIC10YCL057C-A 294 nt7.88□□□□□ -1.15
RDS3Q06835 SPT8YLR055C 1809 nt7.85□□□□□ -1.15
RDS3Q06835 YIR016WYIR016W 798 nt7.83□□□□□ -1.16
RDS3Q06835 VPS75YNL246W 795 nt7.82□□□□□ -1.16
RDS3Q06835 SBA1YKL117W 651 nt7.79□□□□□ -1.16
RDS3Q06835 NAT4YMR069W 858 nt7.79□□□□□ -1.16
RDS3Q06835 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt7.77□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 MIR1YJR077C 936 nt7.77□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 YJL225CYJL225C 5277 nt7.77□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 GLK1YCL040W 1503 nt7.77□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 SWE1YJL187C 2460 nt7.74□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 RAX1YOR301W 1308 nt7.74□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 BNA2YJR078W 1362 nt7.73□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 MSF1YPR047W 1410 nt7.73□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 THI74YDR438W 1113 nt7.73□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 TIM17YJL143W 477 nt7.73□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 MIC12YBR262C 321 nt7.73□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 SHM2YLR058C 1410 nt7.71□□□□□ -1.17
RDS3Q06835 XDJ1YLR090W 1380 nt7.7□□□□□ -1.18
RDS3Q06835 PAU7YAR020C 168 nt7.67□□□□□ -1.18
RDS3Q06835 YGR201CYGR201C 678 nt7.65□□□□□ -1.18
RDS3Q06835 NIT1YIL164C 600 nt7.65□□□□□ -1.18
RDS3Q06835 DAT1YML113W 747 nt7.65□□□□□ -1.18
RDS3Q06835 HHO1YPL127C 777 nt7.65□□□□□ -1.18
RDS3Q06835 GDH3YAL062W 1374 nt7.64□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 RDN37-1RDN37-1 5354 nt7.64□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 RDN37-2RDN37-2 5354 nt7.64□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 SGT2YOR007C 1041 nt7.63□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 BOR1YNL275W 1731 nt7.63□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 UBA4YHR111W 1323 nt7.62□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 SHB17YKR043C 816 nt7.62□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 CCA1YER168C 1641 nt7.62□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 YDR010CYDR010C 333 nt7.6□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 YGL034CYGL034C 366 nt7.59□□□□□ -1.19
RDS3Q06835 DUS1YML080W 1272 nt7.58□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 YSR3YKR053C 1215 nt7.56□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 AVT6YER119C 1347 nt7.55□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 AGP1YCL025C 1902 nt7.55□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 RET2YFR051C 1641 nt7.55□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 FUR4YBR021W 1902 nt7.53□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 GOR1YNL274C 1053 nt7.53□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 HSP60YLR259C 1719 nt7.52□□□□□ -1.2
RDS3Q06835 XYL2YLR070C 1071 nt7.52□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 YMR244WYMR244W 1068 nt7.52□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 NVJ2YPR091C 2313 nt7.52□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 PHO89YBR296C 1725 nt7.5□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 YCR087WYCR087W 516 nt7.5□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 DUT1YBR252W 444 nt7.5□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 GLR1YPL091W 1452 nt7.49□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 YCR102CYCR102C 1107 nt7.49□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 NDI1YML120C 1542 nt7.47□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 RBG1YAL036C 1110 nt7.47□□□□□ -1.21
RDS3Q06835 AIM45YPR004C 1035 nt7.46□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 YCL074WYCL074W 927 nt7.45□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 BMT6YLR063W 1098 nt7.44□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 SFA1YDL168W 1161 nt7.43□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 PRP4YPR178W 1398 nt7.43□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 COQ2YNR041C 1119 nt7.42□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 MRP20YDR405W 792 nt7.41□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 NBP35YGL091C 987 nt7.41□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 AQY2YLL052C 450 nt7.4□□□□□ -1.22
RDS3Q06835 STR3YGL184C 1398 nt7.38□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 RBG2YGR173W 1107 nt7.38□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.38□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 DPS1YLL018C 1674 nt7.38□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 YKR005CYKR005C 1578 nt7.37□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 TIR3YIL011W 810 nt7.37□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 SHH4YLR164W 507 nt7.36□□□□□ -1.23
RDS3Q06835 RDN18-1RDN18-1 1800 nt7.36□□□□□ -1.23
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